More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0143 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  100 
 
 		 265 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  93.59 
 
 		 234 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3417  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.56 
 
 		 232 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.901274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3071  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.11 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6653  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 238 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879715  hitchhiker  0.00000102566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2153  two component LuxR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 213 aa  151  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.848776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2835  two component LuxR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803464  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0272  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264008  normal  0.348846 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1621  capsular synthesis response regulator transcription regulator protein  40.44 
 
 		 219 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  32.59 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  33.94 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  33.94 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  34.1 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  34.09 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  34.09 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  34.09 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  33.94 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  34.09 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  34.09 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  34.09 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  34.09 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  34.09 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  34.09 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  34.09 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  32.17 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0622  transcriptional regulator UhpA  33.04 
 
 		 208 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  34.09 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  34.09 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.84 
 
 		 215 aa  99.8  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0735  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 		 213 aa  99.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  32.42 
 
 		 216 aa  99.4  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  35.29 
 
 		 213 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4235  two component LuxR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 215 aa  98.6  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 215 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 214 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  34.26 
 
 		 220 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  32.88 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  32.88 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  32.88 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 217 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.39 
 
 		 212 aa  97.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  31.56 
 
 		 230 aa  96.3  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 213 aa  96.3  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 196 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  33.49 
 
 		 196 aa  95.5  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  33.49 
 
 		 196 aa  95.5  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.07 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 222 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.51 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1895  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.87 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  33.78 
 
 		 215 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.97 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1904  two component LuxR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 218 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0420846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 235 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3986  two component LuxR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.039666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.15 
 
 		 220 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 210 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4692  two component LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00363591  hitchhiker  0.0000170982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  31.39 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  28.57 
 
 		 212 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 232 aa  93.2  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.51 
 
 		 218 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6665  two component LuxR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 225 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0397086  normal  0.0268041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.05 
 
 		 232 aa  93.2  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  30.59 
 
 		 216 aa  92.8  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  30.94 
 
 		 207 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 209 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 228 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  29.03 
 
 		 214 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 213 aa  92.8  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  29.03 
 
 		 214 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 211 aa  92.8  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 207 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  30.88 
 
 		 214 aa  92.4  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 210 aa  92.4  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  29.03 
 
 		 214 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  29.03 
 
 		 214 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  29.03 
 
 		 214 aa  92.4  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  29.03 
 
 		 214 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 214 aa  92.4  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  29.03 
 
 		 214 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  34.23 
 
 		 209 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  29.03 
 
 		 226 aa  92  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 231 aa  92  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  0.200888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>