More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3993 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  99.63 
 
 		 272 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  91.11 
 
 		 272 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 266 aa  254  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  47.53 
 
 		 261 aa  244  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  46.77 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  39.38 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  37.12 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  38.61 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 266 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 280 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  36.2 
 
 		 227 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  32.18 
 
 		 292 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 257 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  32.54 
 
 		 257 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  27.86 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  27.27 
 
 		 273 aa  99.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  34.01 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  27.97 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  27.24 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  25.56 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  27.6 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  25.7 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  27.16 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1639  hypothetical protein  82.35 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.866433 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 243 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  35.8 
 
 		 556 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 927 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13460  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  54.55 
 
 		 472 aa  55.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 879 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 982 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 550 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 378 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3498  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 73 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3265  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 74 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 1137 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 492 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 214 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 242 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 213 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2655  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 470 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.149331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 203 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 950 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13650  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.44 
 
 		 464 aa  50.8  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 1084 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 522 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.140358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 217 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.08 
 
 		 515 aa  50.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.937657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  47.06 
 
 		 217 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.13 
 
 		 1019 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23080  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.73 
 
 		 545 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.865531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>