More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1542 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  97.7 
 
 		 261 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  76.54 
 
 		 262 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  73.46 
 
 		 265 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  72.45 
 
 		 266 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  66.54 
 
 		 263 aa  363  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  52.49 
 
 		 275 aa  268  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 268 aa  244  9e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 272 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 268 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  42.97 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  39.85 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 266 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 266 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 280 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  29.12 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  32.4 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  28.94 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  28.57 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  34.32 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  35.5 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  29.01 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  28.52 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  35.02 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 274 aa  95.9  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  29 
 
 		 267 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  29.3 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  29.8 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  28.27 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  26 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.67 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2655  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 470 aa  59.3  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.149331 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.22 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4078  hypothetical protein  39.24 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0439982  normal  0.0668702 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 550 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03730  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.77 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.532687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 556 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01760  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.45 
 
 		 546 aa  55.8  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000265618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 461 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00485  predicted DNA-binding transcriptional regulator  48.15 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3078  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00490  hypothetical protein  48.15 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3087  transcriptional regulator FimZ  48.15 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2491  LuxR response regulator receiver  48.28 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  46 
 
 		 471 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0577  transcriptional regulator FimZ  48.15 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0610  transcriptional regulator FimZ  48.15 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>