More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6270 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  30.43 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 257 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  30.92 
 
 		 257 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  27.68 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  27.13 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  25 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  25.78 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  23.2 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0774  regulatory protein, LuxR  25.68 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 285 aa  62  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 285 aa  62  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  23.95 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  26.95 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  33.9 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  33.61 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  27.1 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  26.63 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  26.92 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  50.88 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 274 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  41.77 
 
 		 901 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 259 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1038  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.942109  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  28.72 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 879 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0851  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.26 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2911  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 301 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  29.1 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 303 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1888  two component transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 212 aa  49.3  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 856 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  30.95 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 215 aa  48.9  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 275 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3242  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 213 aa  48.9  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000371761  hitchhiker  0.000468813 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3498  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 73 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0677  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  45.1 
 
 		 356 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>