61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4633 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  100 
 
 		 273 aa  558  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  44.4 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  28.69 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 269 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  25.83 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  28.48 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0774  regulatory protein, LuxR  25.84 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  33.67 
 
 		 893 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  25.3 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 285 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  40 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  21.89 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 278 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  40 
 
 		 220 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4712  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4343  response regulator receiver  39.34 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2670  LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1236  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.23752  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 215 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  33.85 
 
 		 312 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1286  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.92 
 
 		 215 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.13459  normal  0.233078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2086  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 220 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3813  PAS sensor protein  29.35 
 
 		 500 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1258  response regulator VieA  37.31 
 
 		 584 aa  42.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.204001  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  26.04 
 
 		 267 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 213 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  36.07 
 
 		 219 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  36.07 
 
 		 219 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 206 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 208 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 209 aa  42.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0833  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 904 aa  42.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2048  transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 280 aa  42.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>