38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1172 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  584  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  26 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 277 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 273 aa  48.9  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  31.85 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  38.83 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0774  regulatory protein, LuxR  38.24 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 265 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  20.88 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  24.61 
 
 		 262 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  30.63 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  24.69 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  23.33 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  21.07 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  21.69 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 269 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 856 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>