More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1234 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 856 aa  1694    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  41.68 
 
 		 893 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 910 aa  100  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 894 aa  85.9  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  28.34 
 
 		 893 aa  85.1  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 926 aa  72.4  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  27.49 
 
 		 867 aa  64.3  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  27.37 
 
 		 912 aa  61.6  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  56.9 
 
 		 176 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  39.81 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  56.9 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3393  transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.269822  hitchhiker  0.000260191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 175 aa  58.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  56.9 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 907 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 454 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  50.98 
 
 		 471 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 536 aa  56.2  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  24.61 
 
 		 845 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  42.65 
 
 		 337 aa  57  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 910 aa  56.2  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 894 aa  55.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  41.41 
 
 		 916 aa  55.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 1089 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.63 
 
 		 469 aa  55.5  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0175254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  49.18 
 
 		 1001 aa  54.7  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 895 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.76 
 
 		 512 aa  53.9  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2725  transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 431 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 508 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3813  PAS sensor protein  39.44 
 
 		 500 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1236  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  53.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.23752  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  26.74 
 
 		 864 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 214 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2762  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  39.19 
 
 		 520 aa  52.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  24 
 
 		 908 aa  52.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 217 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  40.68 
 
 		 884 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  26.02 
 
 		 868 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 221 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4636  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 320 aa  52.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701031  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2294  transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 253 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 876 aa  52  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1980  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 226 aa  51.6  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.893627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 959 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 258 aa  51.6  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.4 
 
 		 894 aa  51.6  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0461  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 542 aa  51.6  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 927 aa  51.6  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  51.2  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 215 aa  51.2  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 222 aa  51.2  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0392  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 529 aa  51.2  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 215 aa  51.2  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 496 aa  51.2  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 215 aa  50.8  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1568  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 211 aa  50.8  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 496 aa  51.2  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 275 aa  50.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  52 
 
 		 237 aa  50.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00480  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.5 
 
 		 606 aa  50.4  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00118843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 881 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 881 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 876 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 267 aa  50.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1015  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 509 aa  50.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.221092  normal  0.129145 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 501 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 919 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0857  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 211 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00237341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  41.07 
 
 		 356 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  47.27 
 
 		 893 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 435 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2108  transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 516 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00926757  normal  0.183235 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2779  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 505 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.980405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 219 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 201 aa  49.7  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0421  transcriptional regulator, LuxR family  34.58 
 
 		 552 aa  50.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0413788  hitchhiker  0.00000000225621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 344 aa  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3894  response regulator receiver protein  42.42 
 
 		 208 aa  49.7  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.52621  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  45.83 
 
 		 887 aa  50.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 522 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  42 
 
 		 904 aa  49.7  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 225 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 215 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0759  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 221 aa  49.3  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 266 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 227 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.196171  normal  0.645513 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 192 aa  49.3  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0703  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 220 aa  49.3  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 953 aa  49.7  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 268 aa  49.3  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  39.29 
 
 		 925 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  27.86 
 
 		 865 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0504  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 217 aa  49.3  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0705101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 262 aa  49.3  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0691  two component LuxR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 227 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  43.64 
 
 		 846 aa  48.9  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  42 
 
 		 903 aa  48.9  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 272 aa  48.9  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  42 
 
 		 903 aa  48.9  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>