More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0956 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 344 aa  682    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  37.54 
 
 		 376 aa  169  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  27.04 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  33.13 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  30.47 
 
 		 378 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  33.21 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3500  LuxR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  35.4 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  32.53 
 
 		 347 aa  105  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  32.59 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  32.6 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  31.2 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1438  LuxR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 151 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  39.74 
 
 		 550 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 204 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 240 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 556 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.39 
 
 		 881 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0675  transcriptional regulator, LuxR family  34.88 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.010777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  35.16 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  53.7 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 918 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10150  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.78 
 
 		 483 aa  55.8  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.906615  hitchhiker  0.00359447 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.08 
 
 		 469 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0175254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 904 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 178 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 175 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7171  LuxR family transcriptional regulator  63.41 
 
 		 76 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 471 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 454 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 178 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  51.72 
 
 		 928 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.75 
 
 		 505 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  56 
 
 		 224 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 894 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0157  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 229 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1794  transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 537 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 950 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2045  LuxR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 547 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50 
 
 		 894 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 910 aa  53.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 435 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5980  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 245 aa  53.1  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 680 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  45.76 
 
 		 917 aa  52.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  49.02 
 
 		 937 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 876 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 881 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 937 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 881 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  49.02 
 
 		 937 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 202 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 952 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 508 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 916 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 950 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  47.17 
 
 		 189 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 952 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 203 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 879 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0615  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 462 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000110739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 927 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 910 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 995 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7170  LuxR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 240 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0591  hypothetical protein  36.05 
 
 		 252 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0133  transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 480 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.384824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  43.06 
 
 		 222 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 907 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  45.1 
 
 		 930 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 879 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1731  response regulator receiver protein  36.47 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 894 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0209  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 487 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213353  normal  0.452607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.92 
 
 		 192 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 956 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2440  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 220 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119534  normal  0.0380024 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 501 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2786  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 511 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0490323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  40.58 
 
 		 929 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 243 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 910 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  47.06 
 
 		 940 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  44.07 
 
 		 919 aa  50.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>