More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0207 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 435 aa  796    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  55 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 954 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  32.32 
 
 		 956 aa  67.4  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  33.2 
 
 		 895 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  49.35 
 
 		 917 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  36.13 
 
 		 938 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 544 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 544 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 544 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 940 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  50.85 
 
 		 913 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 950 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3579  regulatory protein LuxR  50 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0227422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  41.07 
 
 		 937 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 981 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  47.06 
 
 		 934 aa  57.4  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  39.58 
 
 		 940 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 175 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 232 aa  57  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  55.77 
 
 		 178 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 910 aa  57  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  55.77 
 
 		 178 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  56.14 
 
 		 176 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  46.58 
 
 		 903 aa  56.6  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  38.54 
 
 		 959 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 209 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 995 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 556 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2725  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 219 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 219 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 208 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 219 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  39.24 
 
 		 865 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  35.92 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2570  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 224 aa  55.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 224 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 550 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 220 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 894 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  45.16 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  40.79 
 
 		 930 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3147  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 302 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.03 
 
 		 308 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3200  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 205 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  52 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 959 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.64 
 
 		 889 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 927 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 264 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  50 
 
 		 304 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 246 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.05 
 
 		 223 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.253855  normal  0.0592312 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 238 aa  54.3  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 339 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 562 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1358  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 879 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  49.02 
 
 		 937 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.09 
 
 		 881 aa  53.9  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 876 aa  53.9  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 937 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1181  response regulator, positive activator of uhpT transcription  43.75 
 
 		 318 aa  54.3  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041551  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 306 aa  53.9  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 209 aa  53.9  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2699  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 216 aa  54.3  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144323 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 243 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 243 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 222 aa  54.3  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  49.02 
 
 		 937 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 240 aa  53.9  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  29.13 
 
 		 923 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  52 
 
 		 471 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.89 
 
 		 505 aa  53.9  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 		 216 aa  53.9  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.245465  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3730  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 312 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.63 
 
 		 981 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5188  two component response regulator  48.28 
 
 		 220 aa  53.9  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5666  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 312 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4638  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 312 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 918 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 309 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  41.51 
 
 		 309 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 251 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4109  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  47.62 
 
 		 256 aa  53.5  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.721487  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 259 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 251 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 216 aa  53.5  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 344 aa  53.5  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 258 aa  53.5  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 288 aa  53.5  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 235 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>