More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0968 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
938 aa  1782    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  42.77 
 
 
919 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  39.1 
 
 
911 aa  425  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  40.44 
 
 
884 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  42.22 
 
 
913 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  39.36 
 
 
928 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 
909 aa  393  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 
940 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  37.45 
 
 
913 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  35.83 
 
 
917 aa  364  4e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  37.9 
 
 
928 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  37.34 
 
 
927 aa  352  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  37.01 
 
 
928 aa  350  5e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  36.52 
 
 
925 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 
946 aa  336  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  37.67 
 
 
910 aa  324  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  37.83 
 
 
879 aa  318  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 
920 aa  316  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 
923 aa  308  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 
995 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  37.34 
 
 
913 aa  302  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  37.68 
 
 
936 aa  301  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.15 
 
 
923 aa  295  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  33.78 
 
 
955 aa  295  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
950 aa  291  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  35.23 
 
 
892 aa  285  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  37.21 
 
 
905 aa  285  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  36.18 
 
 
884 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 
929 aa  273  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  44.69 
 
 
904 aa  270  7e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  34.87 
 
 
961 aa  263  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
889 aa  254  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  42.76 
 
 
930 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  32.67 
 
 
934 aa  242  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  44.24 
 
 
918 aa  223  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  34.95 
 
 
915 aa  216  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  40.13 
 
 
923 aa  212  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  36.58 
 
 
916 aa  211  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  39.04 
 
 
953 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  43.25 
 
 
919 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  37.9 
 
 
929 aa  189  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  39.48 
 
 
927 aa  184  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  37.74 
 
 
922 aa  182  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  29.09 
 
 
977 aa  170  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  33.28 
 
 
835 aa  159  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  39.69 
 
 
1064 aa  151  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  42.28 
 
 
240 aa  144  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  30.34 
 
 
893 aa  140  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  28.97 
 
 
959 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
919 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  32.22 
 
 
919 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  32.22 
 
 
919 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  35.19 
 
 
937 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
937 aa  132  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  35.19 
 
 
937 aa  132  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  44.62 
 
 
940 aa  128  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  35.67 
 
 
923 aa  120  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  39.69 
 
 
903 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  52.17 
 
 
894 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  34.89 
 
 
916 aa  106  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  44.7 
 
 
894 aa  103  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
881 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
881 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
876 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  33.23 
 
 
929 aa  102  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  41.43 
 
 
189 aa  97.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  29.74 
 
 
948 aa  94.7  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  47.93 
 
 
921 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  47.93 
 
 
921 aa  92.8  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  47.93 
 
 
921 aa  92.8  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 
998 aa  92  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  35.67 
 
 
921 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  35.98 
 
 
910 aa  85.5  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
1000 aa  84  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  39.1 
 
 
947 aa  84  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  33.51 
 
 
940 aa  83.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  36.4 
 
 
952 aa  81.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  33.13 
 
 
919 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
877 aa  78.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  40.31 
 
 
951 aa  78.2  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 
932 aa  76.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  27.88 
 
 
998 aa  75.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  39.85 
 
 
974 aa  75.5  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.95 
 
 
981 aa  74.7  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  30.89 
 
 
1054 aa  74.3  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
236 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  29.47 
 
 
953 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  30.41 
 
 
1015 aa  72.4  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  41.91 
 
 
960 aa  72.4  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  31.4 
 
 
1029 aa  70.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  32.88 
 
 
541 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 
927 aa  70.5  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  30.07 
 
 
967 aa  69.3  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  41.38 
 
 
947 aa  68.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  33.69 
 
 
973 aa  68.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 
937 aa  68.2  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  28.9 
 
 
907 aa  67.8  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  31.37 
 
 
946 aa  67.8  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
229 aa  67.8  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
1085 aa  67  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>