More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1222 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 926 aa  1847    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  36.86 
 
 		 845 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  30.52 
 
 		 893 aa  306  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 894 aa  283  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 907 aa  223  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 910 aa  154  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  26.9 
 
 		 912 aa  144  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  27.5 
 
 		 908 aa  127  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  29.13 
 
 		 867 aa  117  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 864 aa  110  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 868 aa  107  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 880 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  30.39 
 
 		 903 aa  98.2  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  31.03 
 
 		 1001 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  29.34 
 
 		 562 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  27.38 
 
 		 884 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  27.8 
 
 		 865 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  24.01 
 
 		 893 aa  84.3  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  27.56 
 
 		 871 aa  78.2  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  29.26 
 
 		 884 aa  70.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 856 aa  65.5  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  44.57 
 
 		 955 aa  64.7  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  52.63 
 
 		 923 aa  64.3  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 1104 aa  63.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 		 959 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.96 
 
 		 881 aa  62.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 909 aa  62.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 1084 aa  61.6  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  46.24 
 
 		 919 aa  61.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  33.12 
 
 		 876 aa  60.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  41.76 
 
 		 893 aa  60.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  47.67 
 
 		 998 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 		 910 aa  60.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 895 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 		 929 aa  59.3  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.88 
 
 		 862 aa  59.3  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 894 aa  59.3  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 889 aa  58.9  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  48.21 
 
 		 961 aa  58.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  27.04 
 
 		 953 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 1089 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 997 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2180  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 222 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 928 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  55.74 
 
 		 907 aa  56.6  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 981 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 224 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 881 aa  57  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 959 aa  56.6  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 881 aa  57  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 879 aa  56.2  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 876 aa  57  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  58.82 
 
 		 884 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 204 aa  55.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 927 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  57.14 
 
 		 884 aa  55.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 904 aa  55.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 970 aa  55.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  53.85 
 
 		 855 aa  54.7  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4247  two component LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 210 aa  54.7  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798903  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  49.02 
 
 		 934 aa  54.7  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 1074 aa  54.7  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 923 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  51.85 
 
 		 936 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.22 
 
 		 981 aa  54.3  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 		 998 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  34.36 
 
 		 956 aa  54.3  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 952 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 960 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 222 aa  53.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 946 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  47.54 
 
 		 1336 aa  53.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 928 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 556 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 454 aa  53.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  50.98 
 
 		 900 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 948 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  51.67 
 
 		 932 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 175 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.26 
 
 		 232 aa  52.8  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 218 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 918 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 218 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  39.51 
 
 		 918 aa  53.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 943 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3046  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 218 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.826568  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2183  tetratricopeptide TPR_4  31.76 
 
 		 660 aa  53.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0244754  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  40.51 
 
 		 892 aa  52.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 921 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 215 aa  52.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  53.85 
 
 		 921 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 930 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  50 
 
 		 216 aa  52.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  53.85 
 
 		 921 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 232 aa  52.4  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 471 aa  52  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3894  response regulator receiver protein  45.31 
 
 		 208 aa  52  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.52621  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 908 aa  52  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>