More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3551 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 893 aa  1758    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  41.68 
 
 		 856 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  27.94 
 
 		 867 aa  80.5  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  29.6 
 
 		 871 aa  76.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  25.67 
 
 		 893 aa  73.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  27.74 
 
 		 865 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  23.35 
 
 		 912 aa  68.6  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 864 aa  68.2  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 894 aa  65.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 907 aa  65.1  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 910 aa  63.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  56.16 
 
 		 959 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  26.37 
 
 		 908 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 884 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 910 aa  59.3  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 228 aa  58.9  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  47.22 
 
 		 228 aa  58.9  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 178 aa  58.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 178 aa  58.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  58.49 
 
 		 1001 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  39.19 
 
 		 884 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  51.52 
 
 		 956 aa  58.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  56.86 
 
 		 903 aa  57.8  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  27.89 
 
 		 921 aa  57.8  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 217 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 175 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 454 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 471 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 894 aa  57  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  55.77 
 
 		 176 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 926 aa  56.2  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 508 aa  55.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  56 
 
 		 237 aa  55.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  54 
 
 		 215 aa  55.5  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 223 aa  55.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  48.65 
 
 		 880 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 212 aa  55.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 214 aa  55.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 275 aa  54.7  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  43.02 
 
 		 916 aa  54.7  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 229 aa  55.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0406  transcriptional regulator, LuxR family  42.22 
 
 		 486 aa  54.7  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0269651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 904 aa  54.7  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  51.85 
 
 		 839 aa  54.7  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 292 aa  54.7  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 221 aa  54.7  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 218 aa  54.7  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 970 aa  54.3  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 211 aa  54.3  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 259 aa  54.3  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 876 aa  53.9  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 210 aa  54.3  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 192 aa  54.3  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4082  regulatory protein, LuxR  51.79 
 
 		 888 aa  54.3  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.566011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  42.17 
 
 		 919 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 258 aa  53.9  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 232 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  46.55 
 
 		 222 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  45.33 
 
 		 233 aa  53.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 491 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 788 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 894 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.08 
 
 		 894 aa  53.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.9 
 
 		 221 aa  53.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 212 aa  53.5  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 217 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 197 aa  53.5  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.31 
 
 		 870 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 908 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3163  two component LuxR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 203 aa  53.5  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.932633  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 		 938 aa  53.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  52.08 
 
 		 887 aa  53.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  45.31 
 
 		 373 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1980  two component LuxR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 226 aa  53.5  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.893627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 211 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0795  regulatory protein LuxR  49.12 
 
 		 202 aa  52.4  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000492678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 217 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  51.92 
 
 		 215 aa  52.8  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  52 
 
 		 916 aa  52.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.9 
 
 		 862 aa  52.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 923 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0504  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 217 aa  52.8  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0705101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  26.51 
 
 		 562 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3711  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 637 aa  52.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.731459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0156  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 230 aa  52.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.379873  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3393  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 201 aa  52.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.269822  hitchhiker  0.000260191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 222 aa  52.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 927 aa  52  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  47.3 
 
 		 1089 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 211 aa  52  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.00104431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  45.33 
 
 		 212 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 215 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 263 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 241 aa  52  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5233  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.87 
 
 		 223 aa  52  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114456  hitchhiker  0.000738291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.03 
 
 		 836 aa  51.6  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  47.46 
 
 		 229 aa  51.6  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 1137 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 202 aa  52  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>