More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1223 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  51.06 
 
 		 908 aa  786    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 907 aa  1800    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  29.52 
 
 		 912 aa  241  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 910 aa  231  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  29.35 
 
 		 893 aa  219  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 926 aa  211  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 894 aa  199  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  28.09 
 
 		 868 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  27.25 
 
 		 871 aa  99.4  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  28.97 
 
 		 879 aa  97.8  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  24.7 
 
 		 845 aa  95.9  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  27.25 
 
 		 884 aa  90.9  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  27.92 
 
 		 867 aa  88.6  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  27.86 
 
 		 880 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 864 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  29.85 
 
 		 865 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  29.31 
 
 		 903 aa  81.6  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  29.6 
 
 		 562 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  33.14 
 
 		 884 aa  67.8  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  24.27 
 
 		 893 aa  65.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  47.3 
 
 		 928 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  55 
 
 		 955 aa  60.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  53.45 
 
 		 919 aa  60.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 209 aa  60.1  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0164  response regulator receiver protein  43.01 
 
 		 128 aa  58.9  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  57.69 
 
 		 909 aa  58.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  43.84 
 
 		 925 aa  58.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 879 aa  58.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 940 aa  58.2  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 876 aa  57.4  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 894 aa  57.4  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  54.9 
 
 		 934 aa  57  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.67 
 
 		 224 aa  56.6  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  50.82 
 
 		 827 aa  56.6  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 335 aa  56.2  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 856 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  60.42 
 
 		 884 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  58.82 
 
 		 884 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 946 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.11 
 
 		 217 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 877 aa  55.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  47.14 
 
 		 892 aa  55.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 895 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 953 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  40.79 
 
 		 927 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  52.73 
 
 		 1001 aa  55.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03706  hypothetical protein  31.62 
 
 		 214 aa  55.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  40.57 
 
 		 938 aa  55.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 995 aa  55.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 928 aa  55.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 950 aa  55.1  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 881 aa  54.7  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 889 aa  54.7  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  52 
 
 		 238 aa  54.7  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 		 216 aa  54.7  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.97 
 
 		 923 aa  54.7  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  50.98 
 
 		 913 aa  54.7  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  31.5 
 
 		 908 aa  54.7  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  32.66 
 
 		 937 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  30.98 
 
 		 923 aa  54.7  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 937 aa  54.3  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  32.66 
 
 		 937 aa  54.3  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 943 aa  54.3  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3200  LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 205 aa  54.3  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  50.98 
 
 		 917 aa  54.3  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  25.63 
 
 		 966 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  37.8 
 
 		 893 aa  53.9  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  44.29 
 
 		 792 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 950 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  43.9 
 
 		 930 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  33.33 
 
 		 855 aa  54.3  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 920 aa  53.9  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 931 aa  54.3  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  34.4 
 
 		 216 aa  53.9  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 959 aa  54.3  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 918 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.17 
 
 		 222 aa  54.3  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  50.98 
 
 		 961 aa  53.9  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 998 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 919 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 959 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  43.55 
 
 		 221 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 		 918 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0302  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 227 aa  53.5  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 1074 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002362  DNA-binding HTH domain-containing protein  30.77 
 
 		 214 aa  53.5  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0501055  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 948 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 923 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  39.24 
 
 		 910 aa  52.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 212 aa  52.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 835 aa  52.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 218 aa  52.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  33.59 
 
 		 951 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 1030 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 206 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5778  cyclic nucleotide-binding protein  48.15 
 
 		 353 aa  52.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.714206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 359 aa  52.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0483  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 87 aa  52.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299787 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2814  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  52.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>