More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3551 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 1001 aa  1909    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  29.76 
 
 		 880 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  30.06 
 
 		 865 aa  152  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 884 aa  140  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  28.61 
 
 		 864 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  30.73 
 
 		 884 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  33.71 
 
 		 879 aa  109  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  35.61 
 
 		 867 aa  102  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 926 aa  101  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  27.95 
 
 		 868 aa  98.6  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  27.89 
 
 		 893 aa  92.4  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  31.65 
 
 		 903 aa  82.4  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  28.67 
 
 		 562 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  29.82 
 
 		 871 aa  72.8  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 894 aa  72  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  27.51 
 
 		 845 aa  69.3  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  58.49 
 
 		 876 aa  65.1  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 910 aa  64.7  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 814 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  61.54 
 
 		 907 aa  63.9  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 889 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  61.54 
 
 		 881 aa  63.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  44.44 
 
 		 919 aa  62  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  56.6 
 
 		 894 aa  62  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.57 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  51.61 
 
 		 827 aa  61.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 921 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  57.89 
 
 		 921 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  57.89 
 
 		 921 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  61.54 
 
 		 932 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 881 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 881 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  58.18 
 
 		 959 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 876 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.62 
 
 		 218 aa  60.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 910 aa  59.3  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  51.61 
 
 		 925 aa  59.7  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 		 521 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1568  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.65 
 
 		 211 aa  59.7  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  60.38 
 
 		 960 aa  59.7  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  53.97 
 
 		 959 aa  58.9  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  52.94 
 
 		 893 aa  58.9  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 950 aa  58.9  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  55.17 
 
 		 981 aa  58.9  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  56.36 
 
 		 963 aa  58.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 927 aa  58.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 909 aa  58.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 775 aa  58.5  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 1074 aa  58.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  50.72 
 
 		 931 aa  58.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  55.77 
 
 		 904 aa  58.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  58.49 
 
 		 893 aa  58.2  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  52.83 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 994 aa  57.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  56.6 
 
 		 912 aa  58.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1855  LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 76 aa  57.4  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.101838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  53.45 
 
 		 916 aa  57.4  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 215 aa  57.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  53.85 
 
 		 900 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 908 aa  57.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0244  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.7 
 
 		 216 aa  57  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.27 
 
 		 215 aa  56.6  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 913 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  53.57 
 
 		 862 aa  57  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 946 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  49.28 
 
 		 865 aa  57.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  54.9 
 
 		 884 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 998 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  46.25 
 
 		 920 aa  57  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 		 519 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 956 aa  57  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 925 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  44.16 
 
 		 998 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  37.11 
 
 		 928 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.75 
 
 		 206 aa  56.2  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 877 aa  55.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  46.38 
 
 		 225 aa  56.2  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 		 941 aa  56.2  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 910 aa  56.2  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3393  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 201 aa  56.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.269822  hitchhiker  0.000260191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 882 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.71 
 
 		 216 aa  56.2  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 216 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 216 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  50 
 
 		 227 aa  55.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 948 aa  55.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.7 
 
 		 219 aa  55.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.22 
 
 		 211 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 1052 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  50.91 
 
 		 943 aa  55.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 222 aa  55.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 946 aa  55.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 224 aa  55.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  38.75 
 
 		 951 aa  55.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 175 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1080  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  48.28 
 
 		 823 aa  55.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 907 aa  55.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 253 aa  55.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2409  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 221 aa  55.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  46.43 
 
 		 919 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>