More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1855 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1855  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 76 aa  153  6e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.101838  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0479  LuxR family transcriptional regulator  73.91 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.76967  normal  0.870912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 212 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  59.62 
 
 		 963 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  46.27 
 
 		 880 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.27 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 929 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  51.67 
 
 		 1001 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1154  transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 386 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 998 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 814 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1044  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 938 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 894 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 755 aa  53.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  52.83 
 
 		 865 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1040  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 216 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.723479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  42.37 
 
 		 792 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2735  LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.382705  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 775 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 218 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  50 
 
 		 213 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  50.94 
 
 		 864 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  43.1 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2115  transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 267 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 886 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  41.38 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 231 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 881 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 881 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 222 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  49.02 
 
 		 893 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 876 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 220 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 947 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 230 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.54 
 
 		 216 aa  52  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 244 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  42.59 
 
 		 219 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3219  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 208 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 221 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 218 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  43.86 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0272  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 218 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.353555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 952 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 884 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 223 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 952 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  46.15 
 
 		 903 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 226 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 952 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  43.33 
 
 		 776 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  41.38 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 215 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  40.98 
 
 		 824 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 235 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 921 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 921 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 921 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 904 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 231 aa  50.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 189 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 225 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 209 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.54 
 
 		 226 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  42.19 
 
 		 919 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 879 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  38.33 
 
 		 216 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 845 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 956 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 245 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3287  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 233 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0842926  normal  0.330639 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0156  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.749313  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 974 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 231 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 213 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 219 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 937 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  37.7 
 
 		 215 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  51.79 
 
 		 868 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01711  LuxR family regulatory protein  41.38 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  42.11 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01731  LuxR family regulatory protein  41.38 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 213 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 231 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>