More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1758 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 181 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  45.35 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  34.09 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 913 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  34.09 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  40.23 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  36.05 
 
 		 94 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 894 aa  60.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  47.69 
 
 		 880 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  36 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  40 
 
 		 925 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 943 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 877 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3005  two component LuxR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00815247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 1104 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 997 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 952 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 998 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 925 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  45.28 
 
 		 947 aa  54.7  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  49.06 
 
 		 929 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 895 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 923 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  44.78 
 
 		 919 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 216 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  38.1 
 
 		 215 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1182  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 216 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 887 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 216 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 918 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  49.02 
 
 		 900 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  40.74 
 
 		 893 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  41.54 
 
 		 923 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 908 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 960 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 910 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.37 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 216 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 956 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  47.17 
 
 		 884 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0179  LuxR family DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 818 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  41.54 
 
 		 917 aa  52  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 881 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1537  putative two-component response regulator  44.23 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17670  LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  35.06 
 
 		 218 aa  51.6  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 881 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  49.02 
 
 		 921 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 876 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1855  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 76 aa  51.6  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.101838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  34.43 
 
 		 919 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  48.15 
 
 		 867 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  47.17 
 
 		 864 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 974 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 948 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1314  transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  39.29 
 
 		 943 aa  51.2  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 229 aa  51.2  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 947 aa  50.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 1074 aa  50.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.76 
 
 		 862 aa  50.8  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3630  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 232 aa  51.2  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00295856  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 994 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 233 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4059  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 229 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2305  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  39.19 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 995 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0565  YCII-related protein  35.71 
 
 		 86 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799624 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.69 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 910 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 931 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 951 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 953 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 952 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 884 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.8 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 252 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1359  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.68 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 932 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.4 
 
 		 923 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1650  regulatory protein, LuxR  32.5 
 
 		 794 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315022  normal  0.343942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 952 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 953 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>