More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1040 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1040  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  413  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.723479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1043  response regulator receiver protein  99.25 
 
 		 138 aa  251  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1044  LuxR family transcriptional regulator  97.59 
 
 		 90 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.84 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.61 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  31 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2348  two component LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  25.46 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3523  two component LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  31.55 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  31 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.24 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  31.22 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  32.86 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.77 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.58 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.27 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  27.41 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  27.41 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  27.41 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2246  two component LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0703025  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  27.41 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  27.41 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.06 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  27.41 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  27.41 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0083  two component LuxR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.15 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0855  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.88 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.082304  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.84 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  30.73 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.41 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.79 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  27.41 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  27.41 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04500  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.3 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  26.9 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  27.41 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  27.41 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1121  two component LuxR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.864132  normal  0.872256 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.2 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  27.41 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.13 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  27.88 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  33.03 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  30.62 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  23.98 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.08 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1943  two component LuxR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5557  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.68 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04820  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  29.17 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.08 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6306  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259699  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  29.85 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4341  two component LuxR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 343 aa  62  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  30.57 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1561  LuxR family DNA-binding response regulator  23.72 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0012725  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2092  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.58 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2907  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.37 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0590247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.17 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  29 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  23.62 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  29.41 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.51 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0445779 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.24 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0851  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.26 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>