More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4479 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 865 aa  1701    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  40.05 
 
 		 864 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  38.43 
 
 		 880 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  46.82 
 
 		 562 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4009  ATPas  41.66 
 
 		 690 aa  399  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4083  AAA ATPase  41.66 
 
 		 690 aa  399  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0947323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4512  ATPas  48.3 
 
 		 640 aa  398  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360294  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4239  AAA ATPase  41.66 
 
 		 690 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  38.51 
 
 		 867 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2183  tetratricopeptide TPR_4  49.49 
 
 		 660 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0244754  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  34.54 
 
 		 884 aa  341  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  33.37 
 
 		 884 aa  340  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 868 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  32.59 
 
 		 879 aa  221  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  31.14 
 
 		 871 aa  201  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  29.34 
 
 		 1001 aa  153  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11227  hypothetical protein  49.71 
 
 		 194 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  27.03 
 
 		 893 aa  106  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 894 aa  87.8  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 926 aa  86.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  29.43 
 
 		 845 aa  85.1  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 907 aa  82.4  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 910 aa  80.1  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  27.7 
 
 		 908 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  27.4 
 
 		 903 aa  72.4  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0011  AAA ATPase  28.69 
 
 		 292 aa  72  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.40888 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  27.74 
 
 		 893 aa  68.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  24.05 
 
 		 912 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  59.62 
 
 		 895 aa  65.1  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  45.24 
 
 		 956 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.19 
 
 		 907 aa  61.6  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 876 aa  60.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  56.6 
 
 		 881 aa  58.2  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 953 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 814 aa  57  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 755 aa  55.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 923 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  39.76 
 
 		 792 aa  54.7  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0244  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.1 
 
 		 216 aa  53.9  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1855  LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 76 aa  53.9  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.101838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 981 aa  53.9  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.42 
 
 		 242 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.527048  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 206 aa  53.9  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 212 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  57.69 
 
 		 938 aa  53.9  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 956 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  53.06 
 
 		 204 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 220 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 204 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  49.06 
 
 		 90 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  51.85 
 
 		 776 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 895 aa  53.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  28.5 
 
 		 916 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 959 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  37.65 
 
 		 337 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  35.03 
 
 		 961 aa  53.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4511  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 226 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.68 
 
 		 222 aa  52.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  50.85 
 
 		 963 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 526 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  44.3 
 
 		 526 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  44.3 
 
 		 526 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 775 aa  52.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3572  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 914 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 768 aa  52.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3383  response regulator receiver  37.08 
 
 		 300 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3692  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.08 
 
 		 300 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6527  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 215 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 224 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 209 aa  52  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  44.74 
 
 		 1089 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 556 aa  52  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0759  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.77 
 
 		 221 aa  51.6  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 335 aa  51.6  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 226 aa  51.6  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  43.64 
 
 		 923 aa  51.2  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  54.9 
 
 		 221 aa  51.2  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3567  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.65 
 
 		 251 aa  51.2  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  44.44 
 
 		 916 aa  51.2  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 952 aa  51.2  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 217 aa  51.2  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 952 aa  51.2  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  52.08 
 
 		 207 aa  51.2  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 217 aa  51.2  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 931 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.02 
 
 		 215 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 235 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 982 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  42.7 
 
 		 216 aa  50.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 205 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3574  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.96 
 
 		 301 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0249095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 224 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  47.17 
 
 		 90 aa  50.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 904 aa  50.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 1030 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  42.11 
 
 		 934 aa  50.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.23 
 
 		 223 aa  50.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 211 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 919 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3727  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 226 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>