More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17030 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  100 
 
 		 907 aa  1731    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  28.27 
 
 		 903 aa  66.2  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 925 aa  65.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.04 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  64.71 
 
 		 912 aa  63.9  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  61.54 
 
 		 1001 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  48.1 
 
 		 876 aa  62.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  65.38 
 
 		 998 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  56.14 
 
 		 865 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 889 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 910 aa  60.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  57.63 
 
 		 908 aa  60.1  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34130  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  58.93 
 
 		 853 aa  60.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  62.26 
 
 		 864 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  47.56 
 
 		 919 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  53.45 
 
 		 957 aa  59.3  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  66.67 
 
 		 879 aa  59.3  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0156  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.62 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.379873  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 882 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  59.65 
 
 		 946 aa  58.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  61.11 
 
 		 884 aa  58.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  62.75 
 
 		 904 aa  58.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10344  transcriptional regulator  51.67 
 
 		 832 aa  58.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  62.75 
 
 		 884 aa  58.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  56.9 
 
 		 895 aa  58.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  54.72 
 
 		 884 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  61.82 
 
 		 959 aa  58.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  63.46 
 
 		 938 aa  58.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  54.39 
 
 		 959 aa  58.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  50.7 
 
 		 955 aa  57.8  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 921 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  50.7 
 
 		 921 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  50.7 
 
 		 921 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.97 
 
 		 881 aa  57.4  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  55.36 
 
 		 867 aa  57  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 894 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  59.32 
 
 		 868 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0620  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 843 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50 
 
 		 836 aa  57.4  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  48.53 
 
 		 923 aa  57.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 926 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 950 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  54.72 
 
 		 880 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 952 aa  57  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  56.9 
 
 		 1052 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 910 aa  56.6  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  43.21 
 
 		 927 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 952 aa  57  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  50 
 
 		 934 aa  56.6  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  57  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 213 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 946 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  45.31 
 
 		 224 aa  56.2  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  45.31 
 
 		 224 aa  56.2  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33440  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.79 
 
 		 938 aa  56.2  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 224 aa  55.8  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 204 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.59 
 
 		 221 aa  55.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 956 aa  55.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  53.45 
 
 		 963 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 219 aa  55.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.5 
 
 		 224 aa  55.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 224 aa  55.8  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 1137 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  43.43 
 
 		 928 aa  55.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 218 aa  55.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.75 
 
 		 219 aa  55.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  48.48 
 
 		 928 aa  55.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  50.85 
 
 		 963 aa  55.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  50.79 
 
 		 947 aa  54.7  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  61.22 
 
 		 884 aa  54.7  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  57.69 
 
 		 928 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 232 aa  54.3  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 210 aa  53.9  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  57.69 
 
 		 931 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  57.41 
 
 		 909 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 845 aa  54.3  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 929 aa  53.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7377  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 216 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 231 aa  53.5  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 937 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 222 aa  53.5  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 214 aa  53.5  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 211 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  55.93 
 
 		 916 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 228 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  39.73 
 
 		 228 aa  53.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0759  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 221 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 1085 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  50.91 
 
 		 961 aa  53.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 224 aa  53.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  54.55 
 
 		 799 aa  52.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.5 
 
 		 215 aa  52.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 211 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0443  LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 845 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0656  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 218 aa  52.8  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.214241 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0453  LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 845 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00902802  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  52 
 
 		 211 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 919 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  52 
 
 		 211 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>