27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4009 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4009  ATPas  100 
 
 		 690 aa  1316    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4083  AAA ATPase  100 
 
 		 690 aa  1316    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0947323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4512  ATPas  62.74 
 
 		 640 aa  687    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360294  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4239  AAA ATPase  99.86 
 
 		 690 aa  1315    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2183  tetratricopeptide TPR_4  62.9 
 
 		 660 aa  713    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0244754  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  42.32 
 
 		 865 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  46.8 
 
 		 562 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  32.27 
 
 		 864 aa  239  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 880 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  30.54 
 
 		 884 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  31.34 
 
 		 884 aa  152  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11227  hypothetical protein  55.43 
 
 		 194 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  32.14 
 
 		 867 aa  118  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 868 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  44.37 
 
 		 879 aa  89.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  32.5 
 
 		 893 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  32.3 
 
 		 845 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 910 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 926 aa  50.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  28.39 
 
 		 903 aa  49.3  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  28.24 
 
 		 912 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  29.89 
 
 		 871 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0011  AAA ATPase  29.29 
 
 		 292 aa  47.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.40888 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0600  GTP-binding protein  31.31 
 
 		 230 aa  46.6  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.358533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  30.63 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 907 aa  44.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  26.32 
 
 		 422 aa  44.3  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>