28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0011 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0011  AAA ATPase  100 
 
 		 292 aa  586  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.40888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 864 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 868 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  29.71 
 
 		 867 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  28.1 
 
 		 879 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  28.69 
 
 		 865 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 894 aa  72.4  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  24.41 
 
 		 880 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 910 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  27.31 
 
 		 884 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  27.95 
 
 		 893 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  26.15 
 
 		 908 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4512  ATPas  30.94 
 
 		 640 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360294  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  25.85 
 
 		 884 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2183  tetratricopeptide TPR_4  32.64 
 
 		 660 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0244754  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  25.77 
 
 		 871 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  25.38 
 
 		 903 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 907 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  24.34 
 
 		 562 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 		 1908 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4239  AAA ATPase  29.29 
 
 		 690 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4083  AAA ATPase  29.29 
 
 		 690 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0947323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4009  ATPas  29.29 
 
 		 690 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  25.42 
 
 		 845 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 926 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  30.89 
 
 		 669 aa  43.5  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  31.03 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 975 aa  42.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>