More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3560 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 893 aa  1768    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  60.45 
 
 		 894 aa  964    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 926 aa  295  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 907 aa  214  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  28.34 
 
 		 908 aa  186  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 910 aa  176  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  30.75 
 
 		 845 aa  174  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  29.98 
 
 		 880 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  31.96 
 
 		 867 aa  114  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  29.34 
 
 		 864 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  24.76 
 
 		 893 aa  108  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  26.81 
 
 		 865 aa  107  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 		 879 aa  105  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  30.1 
 
 		 868 aa  104  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  29.7 
 
 		 884 aa  101  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  30.47 
 
 		 884 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  24.39 
 
 		 912 aa  98.2  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  31.61 
 
 		 871 aa  93.6  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  28.18 
 
 		 562 aa  84.7  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 856 aa  80.5  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  31.47 
 
 		 1001 aa  78.2  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  28.67 
 
 		 903 aa  73.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4512  ATPas  35.03 
 
 		 640 aa  71.2  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360294  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0011  AAA ATPase  27.95 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.40888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  33.59 
 
 		 876 aa  63.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.14 
 
 		 881 aa  61.6  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  43.69 
 
 		 955 aa  60.1  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2183  tetratricopeptide TPR_4  32.72 
 
 		 660 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0244754  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 946 aa  59.7  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  44.05 
 
 		 981 aa  58.9  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  38.67 
 
 		 221 aa  57.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  25.21 
 
 		 966 aa  56.6  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 223 aa  56.6  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 909 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  26.63 
 
 		 916 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3086  transcriptional regulator, LuxR family  36.44 
 
 		 695 aa  56.2  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 203 aa  56.2  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 288 aa  55.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 309 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.17 
 
 		 308 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4009  ATPas  32.5 
 
 		 690 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4083  AAA ATPase  32.5 
 
 		 690 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0947323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  29.15 
 
 		 929 aa  55.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4239  AAA ATPase  33.12 
 
 		 690 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  53.7 
 
 		 919 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 235 aa  55.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 273 aa  55.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  38.95 
 
 		 923 aa  55.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  54.17 
 
 		 309 aa  55.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0618  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 215 aa  55.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 259 aa  55.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 273 aa  55.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 273 aa  55.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 235 aa  55.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 908 aa  55.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 246 aa  55.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 235 aa  55.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 264 aa  55.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 251 aa  54.7  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 243 aa  54.7  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 938 aa  54.7  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 251 aa  54.7  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 243 aa  54.7  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  38.69 
 
 		 923 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 242 aa  54.7  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 194 aa  54.7  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 929 aa  54.3  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4026  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 200 aa  54.3  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 508 aa  54.3  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 910 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 220 aa  53.9  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 889 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 361 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 235 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 556 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 305 aa  54.3  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  40.7 
 
 		 900 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 775 aa  53.5  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 213 aa  53.5  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3393  transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 201 aa  53.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.269822  hitchhiker  0.000260191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 218 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 219 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  34.74 
 
 		 893 aa  53.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  26.09 
 
 		 919 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 217 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1314  transcriptional regulator, LuxR family  35.9 
 
 		 204 aa  53.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  44.58 
 
 		 959 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  54.39 
 
 		 1089 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  29.26 
 
 		 921 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  32.5 
 
 		 937 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0894  putative outer membrane component of efflux system  32.91 
 
 		 211 aa  52.8  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00401485  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.24 
 
 		 862 aa  52.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 928 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 309 aa  52.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 218 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.31 
 
 		 894 aa  52  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  32.5 
 
 		 937 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 865 aa  52.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 952 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 952 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>