More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1224 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  60.45 
 
 		 893 aa  1031    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 894 aa  1774    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 926 aa  292  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  28.93 
 
 		 845 aa  255  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 907 aa  226  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 910 aa  170  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  24.89 
 
 		 912 aa  154  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 		 908 aa  135  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  29.1 
 
 		 864 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  29.95 
 
 		 880 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  31.96 
 
 		 879 aa  114  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  30.18 
 
 		 867 aa  111  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  26.75 
 
 		 865 aa  107  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  24.6 
 
 		 893 aa  103  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  28.48 
 
 		 868 aa  102  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  27.76 
 
 		 884 aa  98.6  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 884 aa  97.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  27.36 
 
 		 903 aa  97.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 856 aa  90.1  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  31.91 
 
 		 562 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0011  AAA ATPase  29.53 
 
 		 292 aa  83.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.40888 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  30.79 
 
 		 871 aa  82.4  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4512  ATPas  36 
 
 		 640 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360294  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  28.73 
 
 		 919 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.92 
 
 		 881 aa  72.4  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  28.36 
 
 		 1001 aa  71.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  40.57 
 
 		 923 aa  67.4  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  44.66 
 
 		 955 aa  66.6  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2183  tetratricopeptide TPR_4  37.09 
 
 		 660 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0244754  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.96 
 
 		 907 aa  65.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 876 aa  63.9  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  44.71 
 
 		 919 aa  61.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 940 aa  60.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  45.35 
 
 		 995 aa  59.3  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  39.77 
 
 		 865 aa  59.3  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  26.13 
 
 		 1029 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  29.62 
 
 		 929 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  53.97 
 
 		 337 aa  59.7  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 909 aa  58.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  26.61 
 
 		 921 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  38 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 908 aa  58.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  39.77 
 
 		 917 aa  57  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 946 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 775 aa  57.4  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 246 aa  56.6  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 264 aa  56.6  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0618  LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 215 aa  56.2  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 		 928 aa  56.2  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 235 aa  55.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 273 aa  56.2  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 217 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 251 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 243 aa  55.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 251 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 259 aa  55.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 243 aa  56.2  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 242 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 273 aa  56.2  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 273 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 235 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 235 aa  55.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  58.82 
 
 		 918 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 288 aa  55.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 228 aa  55.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  48.65 
 
 		 959 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3704  LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 220 aa  55.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0339608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 222 aa  55.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 335 aa  55.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 235 aa  55.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 927 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 212 aa  55.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  36.59 
 
 		 1063 aa  55.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 1089 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  34.23 
 
 		 923 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 910 aa  55.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3200  LuxR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 205 aa  55.1  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2674  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 203 aa  55.1  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 		 903 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 905 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 981 aa  54.7  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 203 aa  54.7  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 344 aa  54.3  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 956 aa  54.3  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  27.08 
 
 		 966 aa  54.3  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 1118 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 894 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 258 aa  54.3  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.24 
 
 		 862 aa  53.9  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 889 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1314  transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 204 aa  54.3  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  38 
 
 		 223 aa  54.3  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  36.67 
 
 		 930 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  41.98 
 
 		 196 aa  54.3  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2409  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 221 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0795  regulatory protein LuxR  47.37 
 
 		 202 aa  53.9  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000492678  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  28.77 
 
 		 965 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 894 aa  53.9  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 378 aa  53.9  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>