More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0920 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  59.44 
 
 
864 aa  898    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  100 
 
 
880 aa  1732    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  44.05 
 
 
867 aa  575  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  38.32 
 
 
865 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  36.16 
 
 
884 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  36.21 
 
 
884 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  32.16 
 
 
868 aa  251  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 
871 aa  240  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  33.75 
 
 
562 aa  238  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4512  ATPas  31.56 
 
 
640 aa  218  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360294  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  35.25 
 
 
879 aa  177  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  29.3 
 
 
1001 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4009  ATPas  33.66 
 
 
690 aa  165  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4083  AAA ATPase  33.66 
 
 
690 aa  165  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0947323  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4239  AAA ATPase  33.66 
 
 
690 aa  165  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2183  tetratricopeptide TPR_4  32.94 
 
 
660 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0244754  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  29.98 
 
 
893 aa  124  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
894 aa  112  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
926 aa  111  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  26.54 
 
 
908 aa  98.2  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  28.15 
 
 
903 aa  96.3  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  26.11 
 
 
845 aa  94.4  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
907 aa  92.4  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
910 aa  89  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  27.14 
 
 
912 aa  84.3  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0011  AAA ATPase  24.8 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.40888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  34.84 
 
 
876 aa  67.4  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.97 
 
 
881 aa  64.7  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 
181 aa  60.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
240 aa  60.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  50 
 
 
776 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.11 
 
 
242 aa  60.1  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.527048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
216 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 
217 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
226 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
952 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
952 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  54.39 
 
 
938 aa  59.3  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  60.42 
 
 
956 aa  59.3  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1855  LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
76 aa  58.9  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.101838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  54.55 
 
 
216 aa  58.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  47.76 
 
 
755 aa  58.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  34.59 
 
 
895 aa  57.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  53.45 
 
 
213 aa  57.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 
191 aa  57.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
92 aa  57.4  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
92 aa  57.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  27.88 
 
 
916 aa  57.4  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  56.86 
 
 
217 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  53.57 
 
 
893 aa  56.6  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  54.9 
 
 
221 aa  56.6  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  32.68 
 
 
206 aa  56.6  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
302 aa  57  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  38.57 
 
 
218 aa  56.6  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4855  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 
244 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.093919  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  49.3 
 
 
919 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  54.9 
 
 
215 aa  56.6  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  56.36 
 
 
981 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  44.87 
 
 
230 aa  57  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3727  two component LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
226 aa  57  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.36 
 
 
219 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
814 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.72 
 
 
907 aa  56.2  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  54 
 
 
224 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  56.36 
 
 
937 aa  55.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 
213 aa  55.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0855  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 
223 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.082304  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  49.12 
 
 
337 aa  55.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.96 
 
 
217 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 
244 aa  56.2  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 
224 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  58 
 
 
222 aa  55.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  56.6 
 
 
894 aa  55.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  49.06 
 
 
92 aa  55.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11227  hypothetical protein  35.29 
 
 
194 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 
221 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 
239 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.4 
 
 
219 aa  55.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 
556 aa  55.5  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  48.28 
 
 
891 aa  55.5  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  50.98 
 
 
90 aa  55.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  54.9 
 
 
216 aa  55.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  54.24 
 
 
223 aa  55.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  54 
 
 
221 aa  55.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  52.94 
 
 
879 aa  55.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
231 aa  55.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 
215 aa  55.1  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  48.65 
 
 
893 aa  55.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  50.98 
 
 
955 aa  55.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 
981 aa  55.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  49.06 
 
 
90 aa  55.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
222 aa  54.7  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 
910 aa  54.7  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 
220 aa  54.7  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 
210 aa  54.7  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3572  transcriptional regulator, LuxR family  40.79 
 
 
914 aa  54.7  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7606  response regulator receiver protein  47.83 
 
 
214 aa  54.7  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.58 
 
 
203 aa  54.3  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 
953 aa  54.3  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 
913 aa  54.3  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>