More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3154 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
1089 aa  2098    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  37.71 
 
 
959 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 
998 aa  191  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  28.44 
 
 
919 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  29.85 
 
 
956 aa  100  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  27.57 
 
 
956 aa  96.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  27.63 
 
 
895 aa  89.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  26.54 
 
 
961 aa  72.4  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.18 
 
 
1146 aa  69.3  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  65.38 
 
 
937 aa  65.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  47.67 
 
 
554 aa  63.9  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  47.46 
 
 
923 aa  64.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 
913 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  43.37 
 
 
233 aa  61.6  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 
927 aa  61.6  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33440  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.21 
 
 
938 aa  62  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  55.74 
 
 
950 aa  61.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  55.36 
 
 
541 aa  61.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  51.79 
 
 
214 aa  61.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  48.48 
 
 
212 aa  61.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
1030 aa  60.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03511  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  52.94 
 
 
103 aa  60.1  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0867403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.17 
 
 
210 aa  59.7  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
209 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  50 
 
 
198 aa  58.9  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 
225 aa  59.3  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5233  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.96 
 
 
223 aa  59.3  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114456  hitchhiker  0.000738291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 
951 aa  59.3  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
928 aa  58.9  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  39.76 
 
 
212 aa  58.9  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 
1074 aa  58.9  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 
946 aa  58.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  48.21 
 
 
900 aa  58.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0597  transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 
493 aa  58.5  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.882562  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  55.1 
 
 
223 aa  58.2  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  53.7 
 
 
960 aa  57.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05381  transcriptional dual regulator NarL  50.88 
 
 
204 aa  57.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.1 
 
 
235 aa  57.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  49.18 
 
 
919 aa  57.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 
232 aa  57.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
244 aa  57.4  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  55 
 
 
926 aa  57.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  51.85 
 
 
215 aa  56.6  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0436  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 
501 aa  57.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
288 aa  57  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  53.57 
 
 
210 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  56 
 
 
222 aa  57  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 
243 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1737  regulatory protein LuxR  49.23 
 
 
231 aa  56.6  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117285  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2686  two component LuxR family transcriptional regulator  55.77 
 
 
203 aa  56.6  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.17 
 
 
1075 aa  57  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000509  nitrate/nitrite response regulator protein  50.88 
 
 
210 aa  57  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 
243 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28320  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.88 
 
 
220 aa  57  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
210 aa  57  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 
208 aa  57  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  29.18 
 
 
964 aa  57.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  46.97 
 
 
228 aa  57  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0615  transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 
462 aa  56.6  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000110739  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
228 aa  57  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
235 aa  56.2  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 
208 aa  56.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0915  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 
223 aa  56.2  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 
928 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  59.18 
 
 
231 aa  56.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  45 
 
 
934 aa  56.2  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 
203 aa  56.2  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  38.83 
 
 
209 aa  56.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2108  transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 
516 aa  56.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00926757  normal  0.183235 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
995 aa  56.2  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  54.84 
 
 
981 aa  56.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  50.94 
 
 
229 aa  56.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
952 aa  56.2  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
259 aa  56.2  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 
201 aa  56.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
235 aa  56.2  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
235 aa  56.2  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  49.12 
 
 
917 aa  55.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
273 aa  55.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2674  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
203 aa  55.8  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
222 aa  55.8  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 
953 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0707  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 
270 aa  55.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  53.7 
 
 
947 aa  55.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
273 aa  55.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
273 aa  55.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  51.79 
 
 
210 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 
213 aa  55.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2779  transcriptional regulator, LuxR family  42.35 
 
 
505 aa  55.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.980405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  51.79 
 
 
210 aa  55.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  50.91 
 
 
213 aa  55.8  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  51.79 
 
 
210 aa  55.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  51.79 
 
 
210 aa  55.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  51.79 
 
 
210 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  51.79 
 
 
210 aa  55.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  51.79 
 
 
210 aa  55.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  54.9 
 
 
264 aa  55.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 
220 aa  55.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.39 
 
 
206 aa  55.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  51.79 
 
 
210 aa  55.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>