More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3893 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 904 aa  1700    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  47.3 
 
 		 911 aa  602  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  42.24 
 
 		 919 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  41.29 
 
 		 938 aa  405  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 928 aa  392  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  38.03 
 
 		 928 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  39.42 
 
 		 913 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  38.26 
 
 		 884 aa  354  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  37.84 
 
 		 940 aa  350  9e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  37.21 
 
 		 927 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 905 aa  321  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  34.95 
 
 		 929 aa  318  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  37.34 
 
 		 903 aa  317  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 950 aa  313  5.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 		 923 aa  308  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 946 aa  307  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  35.61 
 
 		 940 aa  303  8.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  37.08 
 
 		 920 aa  301  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  36.46 
 
 		 936 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  35.49 
 
 		 879 aa  287  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.73 
 
 		 923 aa  278  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  36.85 
 
 		 919 aa  278  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  33.9 
 
 		 995 aa  274  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  32.62 
 
 		 917 aa  273  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 923 aa  254  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  41.16 
 
 		 925 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  33.33 
 
 		 892 aa  224  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  41.55 
 
 		 918 aa  215  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  36.52 
 
 		 915 aa  211  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  37.88 
 
 		 922 aa  207  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  35.77 
 
 		 929 aa  197  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 894 aa  192  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 927 aa  191  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  38.43 
 
 		 953 aa  184  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  37.46 
 
 		 916 aa  173  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  38.24 
 
 		 955 aa  167  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  38.91 
 
 		 961 aa  157  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 889 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  36.87 
 
 		 923 aa  149  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  30.59 
 
 		 959 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  46.58 
 
 		 240 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 937 aa  142  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  36.11 
 
 		 937 aa  142  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  43.68 
 
 		 937 aa  141  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  29.81 
 
 		 929 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 		 928 aa  136  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  30.74 
 
 		 921 aa  135  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  36.47 
 
 		 910 aa  134  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 919 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  32.71 
 
 		 919 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  32.71 
 
 		 919 aa  128  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  39.09 
 
 		 1064 aa  124  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  49.3 
 
 		 913 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 		 909 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  29.1 
 
 		 893 aa  113  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  34.49 
 
 		 884 aa  111  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  49.63 
 
 		 894 aa  107  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  41.67 
 
 		 934 aa  105  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  44.1 
 
 		 913 aa  104  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 916 aa  100  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  34.16 
 
 		 940 aa  99.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  39.79 
 
 		 930 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  43.92 
 
 		 189 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  35.6 
 
 		 835 aa  96.3  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  38.95 
 
 		 977 aa  96.3  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  33.9 
 
 		 910 aa  92.8  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 		 998 aa  90.5  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  31.13 
 
 		 897 aa  87  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  31.41 
 
 		 1148 aa  85.1  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 946 aa  84.3  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  42.22 
 
 		 947 aa  81.6  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  35.81 
 
 		 960 aa  79  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 877 aa  78.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  28.82 
 
 		 1029 aa  78.2  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 974 aa  78.2  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 1000 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 1141 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 1141 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  34.87 
 
 		 921 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 921 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  34.87 
 
 		 921 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 1141 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 895 aa  75.1  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  37.65 
 
 		 947 aa  75.1  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.34 
 
 		 981 aa  74.7  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.33 
 
 		 992 aa  74.3  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 951 aa  73.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 1141 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 937 aa  72.4  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  29.35 
 
 		 998 aa  72  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  44.9 
 
 		 567 aa  71.2  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  41.41 
 
 		 953 aa  70.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 1015 aa  71.2  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  31.67 
 
 		 914 aa  70.9  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 932 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  30.09 
 
 		 997 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  44 
 
 		 963 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  43.88 
 
 		 574 aa  70.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  45.26 
 
 		 1104 aa  70.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 236 aa  70.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>