More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1095 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 919 aa  1796    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  44.11 
 
 		 895 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  29.11 
 
 		 998 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 959 aa  205  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  29.68 
 
 		 956 aa  198  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  30.29 
 
 		 956 aa  181  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 1030 aa  105  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  26.84 
 
 		 1089 aa  94  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  27.13 
 
 		 919 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 919 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  26.99 
 
 		 919 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  35.19 
 
 		 952 aa  84.7  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  42.14 
 
 		 1074 aa  75.5  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 950 aa  74.3  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 998 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  36.88 
 
 		 918 aa  70.1  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  35.33 
 
 		 932 aa  69.7  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  38.93 
 
 		 1104 aa  68.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  31.98 
 
 		 925 aa  67.8  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  33.08 
 
 		 908 aa  67  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  30.12 
 
 		 931 aa  64.7  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 203 aa  62.4  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  56.86 
 
 		 963 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2725  transcriptional regulator, LuxR family  56.14 
 
 		 431 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 232 aa  59.3  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  28.48 
 
 		 864 aa  58.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  30.77 
 
 		 923 aa  58.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 953 aa  58.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  36.61 
 
 		 940 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  39.2 
 
 		 981 aa  57.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 894 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 876 aa  57.4  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 950 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  38.37 
 
 		 938 aa  57.4  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  49.3 
 
 		 199 aa  57  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  42 
 
 		 937 aa  57.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 224 aa  57  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 224 aa  57  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  50.94 
 
 		 217 aa  56.6  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  32.29 
 
 		 897 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 224 aa  56.6  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  46.67 
 
 		 947 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 999 aa  56.6  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  26.44 
 
 		 901 aa  57  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  49.09 
 
 		 900 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  38.66 
 
 		 562 aa  56.6  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  32.89 
 
 		 951 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  42.19 
 
 		 91 aa  56.2  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 781 aa  56.2  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1181  response regulator, positive activator of uhpT transcription  41.56 
 
 		 318 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041551  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 862 aa  56.2  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 213 aa  55.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  35.07 
 
 		 947 aa  55.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 908 aa  56.2  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 923 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  31.55 
 
 		 541 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 910 aa  55.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.18 
 
 		 308 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 		 905 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  42.19 
 
 		 90 aa  55.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 927 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 929 aa  55.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2674  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  55.1  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 309 aa  55.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  59.18 
 
 		 309 aa  55.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  46.55 
 
 		 919 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 222 aa  55.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  51.85 
 
 		 957 aa  55.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 207 aa  55.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 305 aa  55.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 214 aa  54.7  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  36.56 
 
 		 946 aa  54.7  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 232 aa  54.7  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.51 
 
 		 224 aa  54.7  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  37.78 
 
 		 948 aa  54.7  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  37.36 
 
 		 228 aa  53.9  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 872 aa  54.3  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  38.75 
 
 		 221 aa  54.3  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3768  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 231 aa  54.3  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 231 aa  54.3  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 544 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  41.11 
 
 		 937 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.11 
 
 		 907 aa  54.3  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  53.7 
 
 		 881 aa  54.3  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 544 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 1064 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 910 aa  54.3  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.9 
 
 		 254 aa  53.9  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 909 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  54.9 
 
 		 903 aa  54.3  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  28.57 
 
 		 1090 aa  54.3  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.43 
 
 		 215 aa  53.5  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 241 aa  53.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  36.54 
 
 		 196 aa  53.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  53.85 
 
 		 846 aa  53.5  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 213 aa  53.5  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  43.28 
 
 		 250 aa  53.5  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>