More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2696 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
931 aa  1802    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  45.83 
 
 
943 aa  691    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  39.62 
 
 
925 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  36.87 
 
 
855 aa  405  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  35.5 
 
 
908 aa  364  5.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 
941 aa  337  7e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
994 aa  261  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  44.87 
 
 
1074 aa  191  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  30.28 
 
 
932 aa  92  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  34.05 
 
 
1104 aa  84.7  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 
948 aa  82.8  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.01 
 
 
947 aa  82.8  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  33.47 
 
 
974 aa  81.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  29.46 
 
 
954 aa  79  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  30.02 
 
 
947 aa  78.2  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 
951 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
998 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  29.84 
 
 
960 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  30.17 
 
 
862 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
877 aa  69.3  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  27.22 
 
 
927 aa  66.6  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  30.12 
 
 
919 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 
900 aa  65.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  26.26 
 
 
998 aa  64.7  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  31.74 
 
 
952 aa  64.3  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  50.75 
 
 
925 aa  63.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  32.41 
 
 
1075 aa  62.4  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  36.13 
 
 
946 aa  62  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.22 
 
 
1015 aa  61.6  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.19 
 
 
218 aa  62  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
1000 aa  61.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 
959 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.36 
 
 
967 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  29.51 
 
 
895 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
973 aa  60.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  49.02 
 
 
900 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  26.71 
 
 
1029 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  55.56 
 
 
336 aa  60.1  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.46 
 
 
217 aa  58.9  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.47 
 
 
1089 aa  58.9  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  56.86 
 
 
1001 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
225 aa  58.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 
229 aa  57.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03368  predicted DNA-binding response regulator in two-component regulatory system  27.68 
 
 
200 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000358261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0193  transcriptional regulator, LuxR family  27.68 
 
 
200 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000210245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 
215 aa  57.4  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
919 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  57.69 
 
 
921 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0197  two component LuxR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
200 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000437068  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4883  transcriptional regulator, LuxR family  27.68 
 
 
200 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  52.83 
 
 
919 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  57.69 
 
 
921 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
228 aa  57.4  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  48.21 
 
 
921 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  52.83 
 
 
919 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  57.69 
 
 
921 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 
235 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03321  hypothetical protein  27.68 
 
 
200 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00023179  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3925  transcriptional regulator, LuxR family  27.68 
 
 
200 aa  57.4  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.237516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  30.87 
 
 
940 aa  57.4  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3723  LuxR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
200 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4008  LuxR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
200 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 
953 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  32.74 
 
 
964 aa  56.6  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  40.24 
 
 
228 aa  57  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  29.44 
 
 
893 aa  57  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3824  LuxR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
200 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.201276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 
918 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1953  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
208 aa  56.2  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 
923 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  44.44 
 
 
919 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 
923 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  39.02 
 
 
212 aa  55.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 
956 aa  55.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  54.9 
 
 
963 aa  55.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 
913 aa  55.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 
927 aa  55.5  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 
259 aa  55.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 
217 aa  55.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 
219 aa  55.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  31.12 
 
 
189 aa  55.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  41.56 
 
 
1089 aa  55.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 
916 aa  54.7  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 
209 aa  54.7  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 
876 aa  54.7  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 
943 aa  54.7  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  47.06 
 
 
929 aa  54.3  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  19.92 
 
 
1147 aa  53.9  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  43.86 
 
 
917 aa  53.9  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  40.79 
 
 
927 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 
995 aa  54.3  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
907 aa  53.9  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  40.85 
 
 
929 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 
910 aa  54.3  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  25.58 
 
 
1183 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 
908 aa  54.3  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0618  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 
196 aa  53.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 
845 aa  53.5  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
1030 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 
894 aa  53.5  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>