More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3795 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  100 
 
 		 925 aa  1832    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  40.58 
 
 		 943 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 931 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  39.32 
 
 		 908 aa  475  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 994 aa  472  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  37.65 
 
 		 855 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  39.38 
 
 		 941 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  44.01 
 
 		 1074 aa  200  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  30.41 
 
 		 947 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  31.61 
 
 		 932 aa  117  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  34.34 
 
 		 952 aa  110  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  30.54 
 
 		 948 aa  109  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  36.86 
 
 		 1104 aa  99.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.33 
 
 		 947 aa  94.7  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  35.87 
 
 		 974 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 951 aa  87.4  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  36.82 
 
 		 998 aa  87  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.92 
 
 		 1666 aa  81.3  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.95 
 
 		 1029 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 881 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  29.21 
 
 		 946 aa  74.7  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 877 aa  74.3  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 1151 aa  72.8  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 973 aa  72.8  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 		 983 aa  72.8  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  30.13 
 
 		 940 aa  71.6  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  28.35 
 
 		 966 aa  69.3  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  29.31 
 
 		 954 aa  67.4  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  31.98 
 
 		 919 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  26.57 
 
 		 998 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  32.68 
 
 		 923 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  26.46 
 
 		 1193 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  26.65 
 
 		 953 aa  65.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 1000 aa  65.1  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  27.24 
 
 		 893 aa  64.7  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  30.48 
 
 		 855 aa  64.7  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 		 913 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  34.45 
 
 		 921 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  27.06 
 
 		 864 aa  63.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 215 aa  62.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  30.66 
 
 		 895 aa  62.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 900 aa  62  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  26.56 
 
 		 1084 aa  61.6  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 919 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  27.74 
 
 		 928 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  35.11 
 
 		 919 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  56.36 
 
 		 960 aa  60.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  53.45 
 
 		 925 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  33 
 
 		 919 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  28.42 
 
 		 900 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  25.49 
 
 		 1190 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  26.19 
 
 		 992 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 959 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  50.91 
 
 		 929 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  50 
 
 		 1001 aa  59.3  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  33 
 
 		 910 aa  58.9  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 1015 aa  58.9  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.22 
 
 		 881 aa  59.3  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  26.39 
 
 		 1143 aa  58.9  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  26.77 
 
 		 959 aa  59.3  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  30.56 
 
 		 1101 aa  58.5  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  55.77 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 181 aa  58.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  27.82 
 
 		 1075 aa  58.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  30.45 
 
 		 1188 aa  58.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 907 aa  57.8  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 921 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  53.57 
 
 		 921 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  49.12 
 
 		 919 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  53.57 
 
 		 921 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 895 aa  57.4  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 		 940 aa  57.4  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2421  transcriptional regulator, LuxR family  28.29 
 
 		 939 aa  57.4  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924633  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  25.3 
 
 		 1264 aa  57.4  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  44.12 
 
 		 827 aa  57  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  26.88 
 
 		 1054 aa  56.6  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  28.76 
 
 		 1052 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  34.98 
 
 		 927 aa  56.2  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 909 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  31.28 
 
 		 953 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 1030 aa  55.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  26.49 
 
 		 1006 aa  55.5  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 943 aa  55.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  25.21 
 
 		 927 aa  55.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.19 
 
 		 215 aa  55.1  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  35.26 
 
 		 929 aa  54.7  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 981 aa  54.7  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  28.24 
 
 		 964 aa  55.1  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 541 aa  54.7  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 1118 aa  54.7  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 879 aa  54.3  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 876 aa  54.3  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 967 aa  53.9  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 910 aa  54.3  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  24.52 
 
 		 959 aa  54.3  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.18 
 
 		 1055 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  49.15 
 
 		 836 aa  53.9  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 723 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  25.81 
 
 		 1871 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 889 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>