More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4833 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
994 aa  1909    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  39.32 
 
 
925 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  39 
 
 
908 aa  479  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  36.35 
 
 
943 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  36.38 
 
 
931 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  34.38 
 
 
855 aa  342  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  35.6 
 
 
941 aa  312  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  42.2 
 
 
1074 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  36.93 
 
 
951 aa  110  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  36.64 
 
 
1104 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 
974 aa  100  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  28.24 
 
 
919 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  29.1 
 
 
947 aa  96.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  28.34 
 
 
919 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  28.34 
 
 
919 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  35.98 
 
 
948 aa  95.1  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  32.12 
 
 
952 aa  94  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  29.88 
 
 
932 aa  92.8  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 
998 aa  82.8  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  29.52 
 
 
946 aa  78.2  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
877 aa  77.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  27.97 
 
 
954 aa  72.8  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  37.37 
 
 
943 aa  72.4  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  40.46 
 
 
960 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  25.66 
 
 
998 aa  68.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  41 
 
 
923 aa  67.4  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 
925 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  31.99 
 
 
855 aa  67  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.62 
 
 
947 aa  66.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.29 
 
 
900 aa  65.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 
940 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  25.19 
 
 
1105 aa  62.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 
923 aa  61.6  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  46.48 
 
 
900 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  29.9 
 
 
916 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  28.28 
 
 
956 aa  60.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  21.95 
 
 
1147 aa  60.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 
959 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  38.83 
 
 
977 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  24.58 
 
 
1029 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
973 aa  59.3  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4057  serine/threonine protein kinase  31.14 
 
 
1321 aa  58.9  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.362289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  48.08 
 
 
929 aa  58.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 
995 aa  58.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.5 
 
 
992 aa  58.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  55.56 
 
 
336 aa  58.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2421  transcriptional regulator, LuxR family  28.36 
 
 
939 aa  58.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924633  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  48.08 
 
 
917 aa  58.2  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 
881 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 
881 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  50.91 
 
 
921 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 
876 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  58.82 
 
 
1001 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  30.45 
 
 
938 aa  56.6  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.57 
 
 
881 aa  57  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  27.27 
 
 
723 aa  57  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  41.41 
 
 
904 aa  56.6  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
907 aa  57  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 
215 aa  56.6  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  40.22 
 
 
894 aa  57  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0898  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
217 aa  56.6  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000112877  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  25.62 
 
 
1050 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.62 
 
 
1050 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  44.64 
 
 
919 aa  56.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  29.45 
 
 
916 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  49.06 
 
 
189 aa  55.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 
953 aa  55.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  44.83 
 
 
827 aa  55.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
889 aa  55.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  23.42 
 
 
881 aa  55.5  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  30.58 
 
 
946 aa  55.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  39.42 
 
 
967 aa  55.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  39 
 
 
919 aa  55.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  36.73 
 
 
879 aa  54.7  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
921 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  58.33 
 
 
921 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  58.33 
 
 
921 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  29.27 
 
 
936 aa  54.7  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.4 
 
 
923 aa  54.3  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  25.23 
 
 
1015 aa  53.9  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  33.08 
 
 
1118 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  30.1 
 
 
927 aa  54.3  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 
910 aa  54.3  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.34 
 
 
1053 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  28.31 
 
 
1089 aa  53.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  46.55 
 
 
963 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 
1013 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 
359 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  29.24 
 
 
901 aa  53.5  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2357  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 
234 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  32.04 
 
 
964 aa  53.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0707  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 
270 aa  53.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  27.75 
 
 
919 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 
923 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  27.79 
 
 
1000 aa  53.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.74 
 
 
1666 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  31.72 
 
 
940 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2911  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 
209 aa  52.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 
953 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  24.44 
 
 
1141 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>