More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2665 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 359 aa  712    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  36.29 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 378 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 		 372 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  28.44 
 
 		 356 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 356 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3500  LuxR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 357 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 363 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  34.54 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  31.32 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  30.2 
 
 		 347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  28.96 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1438  LuxR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 367 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7170  LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 240 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2686  LuxR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  22.07 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0591  hypothetical protein  30.57 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2742  LuxR response regulator receiver  42.03 
 
 		 219 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 221 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  45.76 
 
 		 917 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 228 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2880  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 219 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 994 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 229 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  28.89 
 
 		 550 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2723  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2455  response regulator VSRC transcription regulator protein  40.58 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 501 aa  53.1  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2334  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.477601  normal  0.267999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  41.25 
 
 		 959 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  47.06 
 
 		 943 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 931 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 556 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 282 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 1052 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 227 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 894 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 208 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3589  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 210 aa  50.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  0.0443312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  48.08 
 
 		 893 aa  49.7  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 275 aa  49.7  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 303 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  38.67 
 
 		 956 aa  49.7  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 881 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 881 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 876 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  45.1 
 
 		 855 aa  49.7  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 280 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 908 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  31.46 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 867 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1299  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 273 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0170327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  40.98 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 835 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 1074 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 280 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  49.02 
 
 		 189 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  35.37 
 
 		 879 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3305  LuxR family DNA-binding response regulator  42 
 
 		 206 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  46 
 
 		 242 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1023  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 684 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.21 
 
 		 469 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0175254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5980  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 245 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0341  two component LuxR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 216 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  36.51 
 
 		 934 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 492 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 223 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2786  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 511 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0490323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 950 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 919 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 845 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08650  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.29 
 
 		 508 aa  47.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.197798  normal  0.463051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  41.82 
 
 		 919 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  41.82 
 
 		 919 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 953 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3579  regulatory protein LuxR  48.08 
 
 		 213 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0227422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 230 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1291  transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.979242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2357  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 234 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>