More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3644 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
946 aa  1791    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  57.63 
 
 
948 aa  844    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  41.61 
 
 
951 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 
952 aa  365  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  36.74 
 
 
998 aa  357  7.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  36.91 
 
 
960 aa  328  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 
947 aa  327  8.000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  37.78 
 
 
940 aa  302  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  37.51 
 
 
943 aa  287  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  45.19 
 
 
855 aa  158  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 
974 aa  152  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 
932 aa  147  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  35.46 
 
 
1104 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
877 aa  138  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  28.66 
 
 
855 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  27.04 
 
 
943 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  32.33 
 
 
998 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  36.1 
 
 
947 aa  117  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.63 
 
 
1029 aa  107  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  30.21 
 
 
1118 aa  101  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  33.12 
 
 
908 aa  100  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  39.23 
 
 
919 aa  98.6  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  29.31 
 
 
925 aa  95.9  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  34.78 
 
 
913 aa  95.1  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
919 aa  93.6  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  26.24 
 
 
919 aa  93.6  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  26.29 
 
 
919 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.52 
 
 
1190 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  26.55 
 
 
1048 aa  92.4  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  42.52 
 
 
927 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
994 aa  90.5  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.39 
 
 
1089 aa  90.1  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  27.35 
 
 
1050 aa  89.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  43.61 
 
 
937 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.35 
 
 
1050 aa  89.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  43.61 
 
 
937 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  43.61 
 
 
937 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  28.76 
 
 
1022 aa  88.6  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 
928 aa  87.4  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
973 aa  87.4  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  31.44 
 
 
909 aa  87  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  31.44 
 
 
916 aa  86.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.35 
 
 
1160 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  43.36 
 
 
894 aa  86.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  40.51 
 
 
910 aa  86.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  28.91 
 
 
919 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
895 aa  85.1  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  27.9 
 
 
1151 aa  84.7  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  28.86 
 
 
713 aa  84.3  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 
941 aa  84  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  29 
 
 
1013 aa  84  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  30.32 
 
 
923 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  32.96 
 
 
927 aa  83.2  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.27 
 
 
1055 aa  83.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  29.74 
 
 
953 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  27.95 
 
 
900 aa  82  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27.57 
 
 
1193 aa  82  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 
918 aa  81.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 
903 aa  81.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  45.74 
 
 
925 aa  81.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.77 
 
 
1015 aa  80.9  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.15 
 
 
1053 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  29.21 
 
 
916 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.09 
 
 
983 aa  79.7  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  30.11 
 
 
954 aa  79.7  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  42.74 
 
 
928 aa  80.1  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  47.32 
 
 
892 aa  79.7  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  29.58 
 
 
919 aa  80.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  27.22 
 
 
723 aa  80.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  24.69 
 
 
1271 aa  79.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  45.69 
 
 
921 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 
1074 aa  79.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  45.69 
 
 
921 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  39.42 
 
 
940 aa  79.7  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  45.69 
 
 
921 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 
1403 aa  79.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  24.61 
 
 
1227 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
929 aa  79  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  28.63 
 
 
1054 aa  79  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2421  transcriptional regulator, LuxR family  32.13 
 
 
939 aa  78.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924633  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  44.33 
 
 
938 aa  78.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  27.98 
 
 
959 aa  77.8  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.07 
 
 
967 aa  77.8  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  28.47 
 
 
1885 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  31.77 
 
 
884 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 
928 aa  76.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
889 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.16 
 
 
1034 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.73 
 
 
1014 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 
910 aa  76.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  31.63 
 
 
905 aa  75.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  38.35 
 
 
881 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  38.35 
 
 
881 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  38.35 
 
 
876 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 
995 aa  75.1  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  30.21 
 
 
1013 aa  75.1  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  30.25 
 
 
1148 aa  74.7  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  35.02 
 
 
1064 aa  73.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 
913 aa  74.3  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  37.89 
 
 
929 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>