More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1706 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
913 aa  1735    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  47.07 
 
 
915 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  38.09 
 
 
928 aa  405  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  39.07 
 
 
919 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  39.24 
 
 
884 aa  359  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  36.89 
 
 
909 aa  324  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  35.24 
 
 
911 aa  321  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  34.77 
 
 
913 aa  298  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  35.74 
 
 
913 aa  290  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  36.95 
 
 
938 aa  287  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  33.55 
 
 
925 aa  285  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 
946 aa  280  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  41.2 
 
 
916 aa  273  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  33.02 
 
 
930 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  34.65 
 
 
940 aa  261  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 
940 aa  260  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  34.22 
 
 
884 aa  255  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  33.37 
 
 
905 aa  254  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 
920 aa  247  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  36.04 
 
 
879 aa  230  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
919 aa  230  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  31.2 
 
 
919 aa  230  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.26 
 
 
923 aa  230  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  31.2 
 
 
919 aa  229  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  39.79 
 
 
928 aa  227  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  32.64 
 
 
929 aa  225  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  42.96 
 
 
904 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  30.08 
 
 
917 aa  221  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 
995 aa  214  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  31.44 
 
 
977 aa  208  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 
937 aa  200  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  41.63 
 
 
937 aa  200  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  41.4 
 
 
937 aa  197  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
950 aa  194  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  37.78 
 
 
927 aa  194  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  32.8 
 
 
900 aa  194  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  32.08 
 
 
921 aa  193  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  39.57 
 
 
894 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
921 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  31.87 
 
 
921 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 
919 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 
903 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 
918 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  31.66 
 
 
921 aa  184  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  40.49 
 
 
892 aa  183  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  35.96 
 
 
923 aa  180  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 
953 aa  177  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  37.72 
 
 
955 aa  177  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  39.6 
 
 
927 aa  164  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  37.26 
 
 
934 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
889 aa  154  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 
916 aa  150  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  29.32 
 
 
959 aa  147  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  38.08 
 
 
961 aa  144  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
1000 aa  143  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  38.72 
 
 
1064 aa  139  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  38.51 
 
 
910 aa  136  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  32.25 
 
 
835 aa  128  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  34.59 
 
 
929 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  40 
 
 
240 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  32.97 
 
 
919 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  30.14 
 
 
918 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  33.53 
 
 
928 aa  111  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  30.54 
 
 
927 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  46.5 
 
 
881 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  46.5 
 
 
881 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  46.5 
 
 
876 aa  105  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 
929 aa  101  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  36.73 
 
 
923 aa  100  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 
910 aa  98.2  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  33.24 
 
 
923 aa  94.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  35.44 
 
 
897 aa  93.6  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  43.75 
 
 
189 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 
894 aa  92.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  34.46 
 
 
998 aa  90.1  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  44.17 
 
 
893 aa  89  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
877 aa  88.2  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  35.75 
 
 
936 aa  84.7  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 
951 aa  84.7  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 
946 aa  83.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  45.97 
 
 
947 aa  78.2  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 
997 aa  78.2  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  31.15 
 
 
967 aa  77.8  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
948 aa  75.5  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  42.06 
 
 
947 aa  74.3  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  24.56 
 
 
2279 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 
952 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  48.76 
 
 
960 aa  72.8  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  24.43 
 
 
1227 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  32.06 
 
 
1052 aa  71.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  32.63 
 
 
922 aa  70.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
544 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  31.09 
 
 
998 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
544 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
544 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  42.74 
 
 
541 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33440  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  56.9 
 
 
938 aa  68.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 
932 aa  68.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  31.52 
 
 
953 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>