More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0222 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 918 aa  1790    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 1052 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  30.33 
 
 		 916 aa  164  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  27.76 
 
 		 919 aa  141  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 919 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  27.76 
 
 		 919 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  28.56 
 
 		 977 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  28.85 
 
 		 919 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 997 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  30.36 
 
 		 913 aa  100  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  27.83 
 
 		 928 aa  98.6  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  29.27 
 
 		 921 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 921 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  29.27 
 
 		 921 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  32.05 
 
 		 959 aa  89  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  42.11 
 
 		 929 aa  85.5  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  27.48 
 
 		 910 aa  84.3  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  31.64 
 
 		 897 aa  84.3  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  27.82 
 
 		 884 aa  82.8  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 876 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 881 aa  81.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 881 aa  81.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 879 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 937 aa  75.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  29.3 
 
 		 937 aa  75.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  29.49 
 
 		 937 aa  75.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.32 
 
 		 923 aa  73.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 998 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  42.4 
 
 		 915 aa  73.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  34.41 
 
 		 946 aa  72.8  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  34.18 
 
 		 995 aa  72.8  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  27.55 
 
 		 934 aa  72.4  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  36.08 
 
 		 940 aa  72  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  28.74 
 
 		 855 aa  70.1  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  30 
 
 		 884 aa  68.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  39.16 
 
 		 894 aa  67.4  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  36.88 
 
 		 919 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 938 aa  65.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  35.17 
 
 		 895 aa  65.1  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  30.13 
 
 		 913 aa  64.7  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  30.42 
 
 		 917 aa  63.9  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  25.89 
 
 		 927 aa  63.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  26.49 
 
 		 922 aa  63.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  40.4 
 
 		 919 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  29.1 
 
 		 943 aa  63.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  34.32 
 
 		 909 aa  62.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  27.38 
 
 		 893 aa  62.4  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  43.53 
 
 		 900 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  29.54 
 
 		 927 aa  62  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 953 aa  61.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 877 aa  61.2  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  29.65 
 
 		 951 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 889 aa  60.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  30.05 
 
 		 940 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 918 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  34.19 
 
 		 928 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  36.42 
 
 		 953 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  40.86 
 
 		 913 aa  58.9  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  27.76 
 
 		 929 aa  58.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  35.29 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  33.62 
 
 		 955 aa  57.8  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  32.35 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.89 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  50.91 
 
 		 215 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 209 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  34.07 
 
 		 908 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  32.35 
 
 		 242 aa  57.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 215 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1182  two component LuxR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 216 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  41.3 
 
 		 948 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 216 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 950 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.24 
 
 		 881 aa  56.2  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 215 aa  57  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  40.26 
 
 		 216 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  32.67 
 
 		 961 aa  56.2  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  62.22 
 
 		 336 aa  56.2  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 209 aa  56.2  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  34.9 
 
 		 189 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 932 aa  55.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 937 aa  56.2  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 216 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 215 aa  55.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 544 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  51.32 
 
 		 960 aa  55.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 544 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 221 aa  55.5  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 544 aa  55.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  43.69 
 
 		 865 aa  55.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1537  putative two-component response regulator  49.09 
 
 		 217 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17670  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 217 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 216 aa  54.7  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  35.05 
 
 		 233 aa  54.7  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  27.34 
 
 		 923 aa  54.7  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.9 
 
 		 216 aa  53.9  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  32.43 
 
 		 242 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>