More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1892 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 997 aa  1914    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  44.16 
 
 		 916 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  34.57 
 
 		 900 aa  146  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  34.89 
 
 		 929 aa  140  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  36 
 
 		 922 aa  138  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 919 aa  137  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  34.18 
 
 		 919 aa  137  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  34.18 
 
 		 919 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  34.82 
 
 		 919 aa  134  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  33.91 
 
 		 921 aa  131  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 921 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  32.33 
 
 		 921 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  32.33 
 
 		 921 aa  110  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 918 aa  107  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  30.35 
 
 		 953 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  31.64 
 
 		 977 aa  103  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  30.89 
 
 		 923 aa  102  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  33.51 
 
 		 934 aa  100  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 889 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 950 aa  95.1  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  32.04 
 
 		 928 aa  94  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  32.97 
 
 		 955 aa  92.8  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  31.25 
 
 		 892 aa  92  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  32.17 
 
 		 923 aa  90.9  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  31.17 
 
 		 928 aa  89.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  32.14 
 
 		 913 aa  89  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 927 aa  89  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  30.75 
 
 		 909 aa  88.2  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 929 aa  88.2  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 894 aa  86.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  31.3 
 
 		 928 aa  85.9  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  29.37 
 
 		 930 aa  86.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  30.77 
 
 		 929 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  31.98 
 
 		 884 aa  84.7  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  30.97 
 
 		 918 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 946 aa  82.8  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  32.95 
 
 		 1052 aa  81.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  30.41 
 
 		 940 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 992 aa  78.2  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  27.86 
 
 		 1064 aa  78.2  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  29.84 
 
 		 911 aa  77  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 		 913 aa  77.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  31.52 
 
 		 1121 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  32.63 
 
 		 925 aa  77  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  31.2 
 
 		 947 aa  75.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  35.82 
 
 		 923 aa  73.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  28.75 
 
 		 919 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  30.98 
 
 		 910 aa  74.3  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  30.4 
 
 		 917 aa  72.8  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  30.31 
 
 		 916 aa  72.4  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  30.66 
 
 		 1090 aa  72.4  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  28.19 
 
 		 913 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  25.67 
 
 		 1271 aa  72.4  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  30.23 
 
 		 916 aa  71.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  30.53 
 
 		 920 aa  70.5  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  30.91 
 
 		 903 aa  70.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  32.8 
 
 		 940 aa  69.7  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  29.56 
 
 		 998 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  28.77 
 
 		 983 aa  68.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  31.88 
 
 		 995 aa  69.3  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 879 aa  68.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.8 
 
 		 1291 aa  68.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 		 1029 aa  68.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  30.18 
 
 		 961 aa  68.2  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.64 
 
 		 1029 aa  68.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  30.59 
 
 		 927 aa  67.4  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  38.06 
 
 		 910 aa  67  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  30.35 
 
 		 904 aa  66.6  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  40.83 
 
 		 915 aa  67  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.06 
 
 		 1175 aa  65.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.34 
 
 		 1150 aa  65.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  30.58 
 
 		 907 aa  65.1  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.72 
 
 		 1055 aa  64.7  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.93 
 
 		 1081 aa  63.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.32 
 
 		 1403 aa  63.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  29.01 
 
 		 943 aa  63.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.1 
 
 		 1080 aa  62.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  27.71 
 
 		 1054 aa  62.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  29.63 
 
 		 981 aa  62.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  30.66 
 
 		 927 aa  63.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  29.64 
 
 		 953 aa  62  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 881 aa  62  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.05 
 
 		 1006 aa  61.6  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  28.09 
 
 		 919 aa  62  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  29.24 
 
 		 884 aa  61.6  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 189 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 1000 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 900 aa  60.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.94 
 
 		 1141 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  25.06 
 
 		 1134 aa  59.3  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  31.86 
 
 		 903 aa  59.7  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1298 aa  58.9  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 204 aa  59.3  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  27.52 
 
 		 1123 aa  58.9  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  25.81 
 
 		 1051 aa  58.9  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 951 aa  58.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 1030 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  34.71 
 
 		 894 aa  57.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 926 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 881 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>