More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2594 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 920 aa  1757    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  42.36 
 
 		 884 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  39.94 
 
 		 928 aa  462  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  39.89 
 
 		 909 aa  462  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  38.87 
 
 		 919 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  37.41 
 
 		 946 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  37.81 
 
 		 928 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  36.03 
 
 		 927 aa  362  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  35.09 
 
 		 925 aa  341  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  35.03 
 
 		 929 aa  324  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  35.77 
 
 		 913 aa  321  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  36.17 
 
 		 919 aa  317  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 923 aa  316  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  36.26 
 
 		 938 aa  312  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  37.5 
 
 		 913 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  34.91 
 
 		 934 aa  310  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  34.96 
 
 		 940 aa  300  7e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  37.35 
 
 		 904 aa  298  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 950 aa  298  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 903 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 936 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  34.8 
 
 		 879 aa  281  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  42.69 
 
 		 930 aa  263  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  46.75 
 
 		 884 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  40.65 
 
 		 922 aa  244  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.51 
 
 		 923 aa  243  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  32.1 
 
 		 995 aa  241  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  31.02 
 
 		 917 aa  237  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  42.35 
 
 		 928 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  41.82 
 
 		 892 aa  234  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 937 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  43.02 
 
 		 937 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  41.85 
 
 		 918 aa  215  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  38.55 
 
 		 923 aa  204  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  40.71 
 
 		 929 aa  203  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 911 aa  203  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  36.53 
 
 		 916 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 953 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  39.13 
 
 		 955 aa  196  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  37.16 
 
 		 923 aa  191  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  38.95 
 
 		 894 aa  191  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  37.36 
 
 		 961 aa  177  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 913 aa  175  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  38.66 
 
 		 1064 aa  160  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 910 aa  157  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  45 
 
 		 240 aa  153  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 889 aa  145  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  28.73 
 
 		 929 aa  145  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  35.07 
 
 		 927 aa  144  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 921 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  28.07 
 
 		 921 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  28.07 
 
 		 921 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  34.43 
 
 		 937 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 835 aa  122  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  32.7 
 
 		 915 aa  118  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  40.72 
 
 		 905 aa  115  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 919 aa  115  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  29.92 
 
 		 919 aa  115  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  29.92 
 
 		 919 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  28.04 
 
 		 921 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  35.19 
 
 		 940 aa  112  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 		 916 aa  111  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  34.55 
 
 		 977 aa  106  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  36.73 
 
 		 998 aa  100  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  28.5 
 
 		 900 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  35.08 
 
 		 940 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  30.79 
 
 		 997 aa  86.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 894 aa  84.3  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 881 aa  81.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 881 aa  81.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 876 aa  81.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 959 aa  79.7  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 1000 aa  76.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 189 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  28.12 
 
 		 1029 aa  74.7  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 877 aa  74.7  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  38.43 
 
 		 541 aa  74.7  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 1151 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  30.68 
 
 		 919 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  37.72 
 
 		 947 aa  70.5  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.76 
 
 		 981 aa  68.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  27.25 
 
 		 910 aa  68.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 946 aa  68.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 		 907 aa  67  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.04 
 
 		 1146 aa  67  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  32.04 
 
 		 897 aa  67.4  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 1015 aa  66.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 959 aa  65.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 901 aa  65.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  42.4 
 
 		 974 aa  65.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 973 aa  65.1  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  27.63 
 
 		 967 aa  65.1  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  29.37 
 
 		 932 aa  64.3  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.46 
 
 		 954 aa  63.9  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  39.57 
 
 		 927 aa  63.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  47.56 
 
 		 1085 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  29.58 
 
 		 966 aa  63.9  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 882 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 1137 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 544 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>