More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5143 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 903 aa  1756    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  48.9 
 
 		 928 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  67.66 
 
 		 905 aa  1078    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  46.4 
 
 		 930 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  45.71 
 
 		 929 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 937 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  46.91 
 
 		 937 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  45.58 
 
 		 936 aa  591  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  46.7 
 
 		 937 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  48.16 
 
 		 940 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 950 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  44.24 
 
 		 918 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  43.71 
 
 		 919 aa  487  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  39.31 
 
 		 925 aa  485  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  42.54 
 
 		 894 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  39.74 
 
 		 923 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 928 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  38.07 
 
 		 919 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  37.89 
 
 		 911 aa  366  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  38.31 
 
 		 884 aa  360  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 927 aa  335  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 904 aa  303  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  35.97 
 
 		 946 aa  302  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  35.19 
 
 		 928 aa  298  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  35.02 
 
 		 920 aa  273  8.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  36.22 
 
 		 938 aa  272  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  34.98 
 
 		 884 aa  271  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 909 aa  269  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  34.24 
 
 		 913 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  34.85 
 
 		 913 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  33.4 
 
 		 934 aa  261  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  41.28 
 
 		 927 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 879 aa  226  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  29.96 
 
 		 917 aa  220  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  40.23 
 
 		 953 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  38.34 
 
 		 922 aa  204  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  40.23 
 
 		 923 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  29.6 
 
 		 923 aa  195  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 913 aa  193  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  37.95 
 
 		 955 aa  191  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 995 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  50.46 
 
 		 240 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  42.49 
 
 		 910 aa  179  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  29.42 
 
 		 919 aa  172  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  29.42 
 
 		 919 aa  172  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  29.42 
 
 		 919 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  32.55 
 
 		 915 aa  166  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  27.79 
 
 		 897 aa  162  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  36.38 
 
 		 940 aa  158  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 1064 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  31.4 
 
 		 900 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  33.83 
 
 		 916 aa  144  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  37.2 
 
 		 961 aa  141  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  31.58 
 
 		 921 aa  126  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  30.12 
 
 		 927 aa  115  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  38.43 
 
 		 923 aa  107  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  52.85 
 
 		 889 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  34.33 
 
 		 892 aa  95.1  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  30.49 
 
 		 835 aa  89  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 894 aa  88.2  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  40 
 
 		 893 aa  87.8  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 881 aa  87.4  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 881 aa  87.4  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.56 
 
 		 992 aa  87  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 876 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  33.43 
 
 		 940 aa  87  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  41.74 
 
 		 910 aa  85.9  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  28.72 
 
 		 1029 aa  85.9  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  31.05 
 
 		 929 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 1000 aa  82.8  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  34.13 
 
 		 953 aa  82.4  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  37.97 
 
 		 998 aa  82  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  38.22 
 
 		 929 aa  80.9  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.76 
 
 		 947 aa  79.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 189 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  38.67 
 
 		 946 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 877 aa  78.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  30.82 
 
 		 1006 aa  75.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  32.49 
 
 		 921 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 921 aa  74.3  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  29.22 
 
 		 998 aa  74.7  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  32.49 
 
 		 921 aa  74.3  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 959 aa  73.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.81 
 
 		 1190 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  37.59 
 
 		 947 aa  72  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  34.11 
 
 		 974 aa  71.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.16 
 
 		 1150 aa  70.5  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  26.68 
 
 		 967 aa  69.3  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  29.31 
 
 		 997 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.9 
 
 		 954 aa  68.2  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 910 aa  67  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.9 
 
 		 1160 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 932 aa  67.4  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1298 aa  66.6  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  27.02 
 
 		 1133 aa  67  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.87 
 
 		 1422 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  28.9 
 
 		 993 aa  65.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  30.47 
 
 		 914 aa  66.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  26.77 
 
 		 1054 aa  65.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  27.86 
 
 		 1198 aa  65.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>