More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0415 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 911 aa  1764    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  46.31 
 
 		 904 aa  543  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  40.59 
 
 		 919 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  37.42 
 
 		 928 aa  399  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  37.7 
 
 		 928 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  38.41 
 
 		 884 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  38.73 
 
 		 938 aa  379  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  38.28 
 
 		 913 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  37.29 
 
 		 940 aa  355  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 925 aa  340  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  37.2 
 
 		 918 aa  335  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  36.95 
 
 		 905 aa  328  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  34.99 
 
 		 913 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 950 aa  327  9e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  35.84 
 
 		 919 aa  322  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 927 aa  319  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  33.69 
 
 		 928 aa  316  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  33.8 
 
 		 930 aa  309  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  34.37 
 
 		 940 aa  308  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  35.01 
 
 		 936 aa  306  9.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  45.11 
 
 		 909 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  33.76 
 
 		 929 aa  300  6e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 		 894 aa  294  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  33.12 
 
 		 917 aa  293  7e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  34.29 
 
 		 884 aa  291  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 923 aa  289  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.85 
 
 		 923 aa  278  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  35.06 
 
 		 913 aa  276  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 879 aa  273  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  32.23 
 
 		 922 aa  261  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 946 aa  253  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  31.48 
 
 		 995 aa  240  9e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  30.27 
 
 		 923 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 937 aa  210  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  41.63 
 
 		 937 aa  210  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  41.63 
 
 		 937 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 		 927 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  41.42 
 
 		 892 aa  177  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  35.49 
 
 		 953 aa  167  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 920 aa  160  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 915 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  35.77 
 
 		 955 aa  154  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  33.08 
 
 		 916 aa  147  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  36.54 
 
 		 934 aa  141  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 889 aa  139  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  43.44 
 
 		 240 aa  138  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  34.22 
 
 		 923 aa  137  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  41.49 
 
 		 910 aa  126  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  43.01 
 
 		 903 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  34.13 
 
 		 961 aa  125  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  31.91 
 
 		 835 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 1064 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  31.57 
 
 		 959 aa  100  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 1000 aa  98.2  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  41.72 
 
 		 929 aa  97.8  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  32.13 
 
 		 919 aa  97.8  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  32.35 
 
 		 916 aa  92.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 189 aa  91.3  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  34.72 
 
 		 977 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 921 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 881 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  30.4 
 
 		 921 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 881 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  30.09 
 
 		 921 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 876 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  29.44 
 
 		 900 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  43.22 
 
 		 894 aa  88.6  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 998 aa  89  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  27.1 
 
 		 897 aa  87  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  36.65 
 
 		 893 aa  86.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  29.48 
 
 		 921 aa  85.1  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  42.15 
 
 		 947 aa  80.9  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 919 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  26.76 
 
 		 919 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  26.76 
 
 		 919 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  39.46 
 
 		 910 aa  80.1  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  27.01 
 
 		 953 aa  80.1  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  30.45 
 
 		 929 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.68 
 
 		 992 aa  76.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 		 997 aa  76.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  26.31 
 
 		 998 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 1085 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  30.31 
 
 		 960 aa  71.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  33.99 
 
 		 974 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  26.98 
 
 		 927 aa  70.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  37.76 
 
 		 943 aa  68.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.46 
 
 		 1190 aa  68.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  52.24 
 
 		 1085 aa  68.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 882 aa  67.8  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.28 
 
 		 900 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 877 aa  67  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 		 932 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 1137 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  36.5 
 
 		 951 aa  65.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 		 1398 aa  65.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 907 aa  64.7  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.78 
 
 		 981 aa  63.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.5 
 
 		 1014 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  46.27 
 
 		 887 aa  61.6  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>