More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3871 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 913 aa  1785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  44.59 
 
 		 910 aa  546  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  37.54 
 
 		 919 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  38.18 
 
 		 913 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 928 aa  356  8.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  36.49 
 
 		 884 aa  350  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  34.95 
 
 		 909 aa  347  8e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 923 aa  311  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  37.26 
 
 		 938 aa  309  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  34.75 
 
 		 946 aa  297  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 		 925 aa  293  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  31.92 
 
 		 928 aa  282  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  34.64 
 
 		 879 aa  277  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  34.05 
 
 		 940 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  34.01 
 
 		 884 aa  267  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  34.7 
 
 		 913 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 		 905 aa  256  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  40.08 
 
 		 911 aa  249  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  31.15 
 
 		 923 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  39.79 
 
 		 928 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  40.97 
 
 		 930 aa  229  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  28.71 
 
 		 917 aa  205  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  41.58 
 
 		 940 aa  202  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 903 aa  197  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  41.5 
 
 		 927 aa  195  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 920 aa  189  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.98 
 
 		 923 aa  187  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 950 aa  187  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  37.36 
 
 		 892 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  34.85 
 
 		 929 aa  185  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  39.17 
 
 		 918 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  28.17 
 
 		 934 aa  181  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  40.78 
 
 		 919 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 953 aa  172  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  32.82 
 
 		 922 aa  167  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  32.32 
 
 		 916 aa  162  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  37.45 
 
 		 915 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  28.78 
 
 		 959 aa  156  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  34.32 
 
 		 955 aa  155  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 889 aa  149  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 995 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  35.87 
 
 		 961 aa  137  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  32.33 
 
 		 923 aa  127  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  36.72 
 
 		 1064 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 919 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  31.6 
 
 		 919 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  31.6 
 
 		 919 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  30.35 
 
 		 927 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  39.29 
 
 		 240 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 904 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  46.34 
 
 		 927 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  32.1 
 
 		 919 aa  105  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  40.35 
 
 		 977 aa  97.8  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 894 aa  97.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 974 aa  97.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 937 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  37.37 
 
 		 937 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  37.37 
 
 		 937 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  32.87 
 
 		 929 aa  94.4  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  31.26 
 
 		 900 aa  91.3  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  35.08 
 
 		 893 aa  90.9  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  42.22 
 
 		 894 aa  90.5  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  30.63 
 
 		 916 aa  89  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  32.66 
 
 		 940 aa  88.2  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 881 aa  88.2  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 881 aa  88.2  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  36.19 
 
 		 921 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 876 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 189 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 936 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  37.3 
 
 		 947 aa  85.5  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  32.83 
 
 		 921 aa  85.5  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 921 aa  85.1  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  28.38 
 
 		 897 aa  85.1  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  32.83 
 
 		 921 aa  85.1  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  31.68 
 
 		 835 aa  84.7  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  39.61 
 
 		 929 aa  84.7  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 872 aa  82.8  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35.59 
 
 		 947 aa  81.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 1000 aa  82  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  28.47 
 
 		 998 aa  82  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  36.72 
 
 		 946 aa  79.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  38.8 
 
 		 998 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  40.65 
 
 		 910 aa  78.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 951 aa  78.2  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 948 aa  75.1  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 877 aa  74.3  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.19 
 
 		 1075 aa  73.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  28.28 
 
 		 997 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 953 aa  72  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  40.49 
 
 		 952 aa  68.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  37.36 
 
 		 932 aa  68.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  28.53 
 
 		 1398 aa  68.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  32.59 
 
 		 1104 aa  67.8  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 960 aa  65.1  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.56 
 
 		 1150 aa  64.7  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 956 aa  64.7  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 943 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.55 
 
 		 1146 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>