More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1851 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 907 aa  1758    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  31.68 
 
 		 953 aa  218  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  29.64 
 
 		 959 aa  147  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 1000 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  27.68 
 
 		 927 aa  126  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  29.37 
 
 		 927 aa  87.8  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  30.53 
 
 		 928 aa  85.1  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  32.74 
 
 		 910 aa  84.3  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 919 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  26.64 
 
 		 919 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  30.18 
 
 		 893 aa  77  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  29.3 
 
 		 928 aa  77  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 881 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 881 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  26.42 
 
 		 919 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 876 aa  74.7  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  32.26 
 
 		 892 aa  73.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  28.92 
 
 		 884 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  28.6 
 
 		 923 aa  71.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  39.46 
 
 		 189 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  27.91 
 
 		 977 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  43.43 
 
 		 923 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.9 
 
 		 923 aa  68.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  29.81 
 
 		 930 aa  67.8  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  30.09 
 
 		 894 aa  67.4  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 937 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  40.57 
 
 		 937 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  40.57 
 
 		 937 aa  67  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 911 aa  64.7  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  52.54 
 
 		 947 aa  63.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  30.1 
 
 		 940 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  30.58 
 
 		 997 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  29.21 
 
 		 925 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  41.49 
 
 		 929 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 916 aa  62.4  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  32.06 
 
 		 920 aa  62.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  37.09 
 
 		 919 aa  62.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 950 aa  62.4  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  43.18 
 
 		 867 aa  62  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 221 aa  62  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1352  tetratricopeptide TPR_4  26.88 
 
 		 683 aa  62  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  41.11 
 
 		 904 aa  61.6  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  27.6 
 
 		 953 aa  61.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  36.42 
 
 		 913 aa  61.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  32.35 
 
 		 913 aa  60.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  45.45 
 
 		 792 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  26.27 
 
 		 951 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  30.9 
 
 		 879 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  35.18 
 
 		 929 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.82 
 
 		 232 aa  60.1  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  56.86 
 
 		 229 aa  60.1  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 1030 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 229 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.08 
 
 		 217 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  27.08 
 
 		 934 aa  60.1  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  29.08 
 
 		 952 aa  59.3  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 212 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 220 aa  59.3  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  53.85 
 
 		 212 aa  59.3  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 894 aa  58.9  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  34.2 
 
 		 921 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.61 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  54.9 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17340  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  52.94 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0710  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.614335  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  54.9 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 905 aa  58.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1485  transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 952 aa  57.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 223 aa  57.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  56 
 
 		 234 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 244 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.03 
 
 		 215 aa  57  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28320  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.9 
 
 		 220 aa  57.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.41 
 
 		 217 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 230 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 		 244 aa  56.6  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  37.63 
 
 		 919 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.7 
 
 		 224 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 216 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2543  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.59 
 
 		 217 aa  56.6  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473476  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 228 aa  56.6  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0656  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 218 aa  56.6  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.214241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 241 aa  56.6  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  33.16 
 
 		 919 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  31.08 
 
 		 855 aa  57  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  34.92 
 
 		 964 aa  56.6  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  52.94 
 
 		 228 aa  56.6  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 253 aa  56.6  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.82 
 
 		 230 aa  55.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5233  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 223 aa  56.2  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114456  hitchhiker  0.000738291 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 215 aa  55.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 981 aa  56.2  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  54 
 
 		 213 aa  56.2  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 1104 aa  56.2  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  52.83 
 
 		 228 aa  55.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>