More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1637 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  91.11 
 
 		 272 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  91.11 
 
 		 272 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  90.74 
 
 		 272 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  47.91 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  49.81 
 
 		 275 aa  241  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 261 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  46.18 
 
 		 262 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  38.31 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 266 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 266 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 263 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  37.55 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 280 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 282 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  31.85 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  31.72 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  29.53 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  26.95 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  29.5 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  30.45 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  32.34 
 
 		 247 aa  92.4  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  25.94 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  26.04 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1639  hypothetical protein  97.14 
 
 		 142 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.866433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  25.3 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  27.6 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  25.83 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  27.94 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 879 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 982 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 1137 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 927 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3498  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 73 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 235 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13460  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  52.73 
 
 		 472 aa  54.3  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 556 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 213 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3265  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 74 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 205 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0618  LuxR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 215 aa  52.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 550 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 492 aa  52.4  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 363 aa  52.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2655  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 470 aa  52  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.149331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 1084 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  40.74 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  36.63 
 
 		 176 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>