More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4209 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  98.12 
 
 		 266 aa  524  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  95.49 
 
 		 266 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  93.98 
 
 		 266 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  93.98 
 
 		 266 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  93.23 
 
 		 266 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  94.74 
 
 		 266 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  79.92 
 
 		 266 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  79.92 
 
 		 266 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  79.92 
 
 		 266 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  79.61 
 
 		 257 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  79.61 
 
 		 257 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  79.61 
 
 		 257 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  78.82 
 
 		 257 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  56.11 
 
 		 268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  55.34 
 
 		 268 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  57.47 
 
 		 263 aa  254  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 272 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 262 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  41.73 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  40.08 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 280 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 268 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 301 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  33.46 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  35.27 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  30.31 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  35.74 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 252 aa  109  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  35.54 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  35.5 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  27.31 
 
 		 292 aa  97.1  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  27.34 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  25.86 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0032  putative transcriptional regulator  49.25 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.723962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0030  putative transcriptional regulator  49.25 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.514853 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 204 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 680 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  44.93 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  44.93 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0436  transcriptional regulator, LuxR family  43.9 
 
 		 501 aa  59.3  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0132  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.401597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  47.37 
 
 		 913 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  28.16 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  34.04 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0406  transcriptional regulator, LuxR family  47.3 
 
 		 486 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0269651 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3498  transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2655  transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 470 aa  55.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.149331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  40.43 
 
 		 967 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  29.01 
 
 		 993 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.19 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 229 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2837  response regulator receiver protein  39.68 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00000311945  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13650  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.94 
 
 		 464 aa  54.3  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>