More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1845 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  96.5 
 
 		 257 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  79.22 
 
 		 266 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  79.22 
 
 		 266 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  78.82 
 
 		 266 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  78.82 
 
 		 266 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  79.61 
 
 		 266 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  79.61 
 
 		 266 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  79.61 
 
 		 266 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  56.81 
 
 		 268 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  55.25 
 
 		 268 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 263 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 261 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  42.52 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 280 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 262 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  38.49 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  32.39 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 299 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  36.63 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  33.73 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  29.13 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 		 284 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  31.6 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  34.67 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  36 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  27.73 
 
 		 292 aa  92  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  27.2 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  30 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0030  putative transcriptional regulator  49.25 
 
 		 68 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.514853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0032  putative transcriptional regulator  49.25 
 
 		 68 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.723962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  28.93 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 119 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 680 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  28 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0436  transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 501 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2786  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 511 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0490323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 363 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.32 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 879 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3200  LuxR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  41.38 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 918 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 919 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.75 
 
 		 925 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  39.56 
 
 		 912 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 910 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  35.56 
 
 		 920 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3498  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 73 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 242 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.140358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13650  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  36.05 
 
 		 464 aa  53.1  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 522 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  38.75 
 
 		 981 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 950 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 288 aa  52.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  52 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  54.35 
 
 		 914 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>