More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0160 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  100 
 
 		 279 aa  577  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  32.49 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 280 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  33.05 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 282 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 266 aa  95.5  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  36.09 
 
 		 227 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  30.5 
 
 		 275 aa  92.4  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 298 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  28.02 
 
 		 250 aa  85.9  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 257 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  28.81 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  24.71 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  24.53 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  27.8 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  27.45 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  30.84 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  30.2 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2443  LuxR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0277  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 833 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  43.75 
 
 		 960 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  34.44 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5154  LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 510 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 510 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  31.2 
 
 		 496 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.37 
 
 		 947 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1549  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 367 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.730444  normal  0.517994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0620  response regulator receiver protein  45 
 
 		 843 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4282  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2723  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 509 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3221  transcriptional regulator, LuxR family  24.4 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 492 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1260  LuxR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 272 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 229 aa  52.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2103  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 919 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>