More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0620 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0443  LuxR family transcriptional regulator  70.25 
 
 		 845 aa  1020    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10344  transcriptional regulator  58.07 
 
 		 832 aa  786    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0453  LuxR family transcriptional regulator  70.25 
 
 		 845 aa  1020    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00902802  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0620  response regulator receiver protein  100 
 
 		 843 aa  1606    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0430  LuxR family transcriptional regulator  70.01 
 
 		 845 aa  1031    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.32699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0277  response regulator receiver protein  66.87 
 
 		 833 aa  897    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.51 
 
 		 836 aa  312  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3086  transcriptional regulator, LuxR family  37.21 
 
 		 695 aa  271  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  39.76 
 
 		 788 aa  255  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1635  LuxR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 818 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1650  regulatory protein, LuxR  36.84 
 
 		 794 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315022  normal  0.343942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.53 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  31.16 
 
 		 893 aa  64.3  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  43.75 
 
 		 900 aa  61.6  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 919 aa  60.8  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  47.69 
 
 		 919 aa  60.8  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  47.69 
 
 		 919 aa  60.8  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 217 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 215 aa  59.7  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  46.67 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  42.65 
 
 		 977 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 814 aa  58.2  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1403  hypothetical protein  43.1 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2543  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 217 aa  57.4  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473476  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 881 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  53.33 
 
 		 907 aa  57  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 881 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 205 aa  57.4  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  39.64 
 
 		 855 aa  57.4  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 876 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 216 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 550 aa  56.6  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  50 
 
 		 936 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 959 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  44.62 
 
 		 212 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  43.24 
 
 		 231 aa  56.6  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3239  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 274 aa  55.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 244 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0710  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 226 aa  55.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.614335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  43.08 
 
 		 212 aa  55.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  37.78 
 
 		 218 aa  55.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  43.08 
 
 		 233 aa  55.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 232 aa  55.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  52.94 
 
 		 963 aa  55.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0656  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 218 aa  54.7  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.214241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3116  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 215 aa  55.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 248 aa  54.7  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28320  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.98 
 
 		 220 aa  54.7  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 1089 aa  54.3  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 211 aa  54.7  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.33 
 
 		 222 aa  54.3  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 897 aa  54.3  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0277  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 228 aa  54.3  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.0298075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  48 
 
 		 916 aa  54.3  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  50.98 
 
 		 929 aa  54.3  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 755 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  45 
 
 		 279 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 556 aa  54.3  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  50 
 
 		 937 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17340  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  50 
 
 		 232 aa  53.9  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 218 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 916 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1854  transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 75 aa  53.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 208 aa  53.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 894 aa  53.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1181  response regulator, positive activator of uhpT transcription  28.7 
 
 		 318 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041551  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 214 aa  53.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2532  transcriptional regulator, LuxR family  37.35 
 
 		 500 aa  53.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33440  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.27 
 
 		 938 aa  53.5  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 216 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  47.06 
 
 		 229 aa  53.5  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 212 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 216 aa  53.5  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 214 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  52.83 
 
 		 799 aa  52.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  29.25 
 
 		 910 aa  52.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 938 aa  52.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 1052 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.73 
 
 		 228 aa  52.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 216 aa  52.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 956 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 574 aa  52.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  47.17 
 
 		 919 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 226 aa  52  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5726  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 228 aa  52  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 207 aa  52.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 217 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 973 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 1030 aa  52  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5233  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 223 aa  52.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114456  hitchhiker  0.000738291 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  46.67 
 
 		 567 aa  52  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  48.15 
 
 		 231 aa  52.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3205  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 74 aa  52  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.826126  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2998  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 228 aa  52  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4906  response regulator receiver  48.21 
 
 		 205 aa  51.6  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275081  normal  0.875639 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 876 aa  52  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 970 aa  52  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>