190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2728 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  65.54 
 
 		 272 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 269 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  65.3 
 
 		 269 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  55.6 
 
 		 272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  56.18 
 
 		 272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  67 
 
 		 204 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  31.87 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  32.45 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 290 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  31.34 
 
 		 268 aa  92.8  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  30.65 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0774  regulatory protein, LuxR  31.16 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  26.44 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  24.26 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  26.88 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  24.4 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  22.63 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  25.72 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  31.88 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  25.83 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  31.88 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  23.22 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  26.38 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  36.89 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  24.7 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 265 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 263 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  46.3 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  46.3 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  20.74 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  21.32 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  25.47 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  41.3 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 259 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  20 
 
 		 262 aa  48.9  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0272  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264008  normal  0.348846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0347  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  29.46 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3765  two component LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  30.56 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>