115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2781 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 276 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 294 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 294 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 277 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 271 aa  98.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 264 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  28.85 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  28.02 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  27.2 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 284 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  28.06 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  31.85 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  30.63 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1903  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 196 aa  52.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000231921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  32.71 
 
 		 226 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  31.87 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  26.88 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12490  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.58 
 
 		 560 aa  50.4  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  42.31 
 
 		 896 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13460  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.19 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  44.64 
 
 		 903 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0985  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 476 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.880452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  35.59 
 
 		 188 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  20.69 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 204 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4114  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 208 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0576718  normal  0.109105 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13370  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  38.57 
 
 		 537 aa  46.2  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.925648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 275 aa  46.2  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 261 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 893 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 320 aa  45.8  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 219 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 221 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  34.09 
 
 		 839 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 		 223 aa  45.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.37 
 
 		 222 aa  45.8  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 894 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 845 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  35.06 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3764  response regulator receiver  39.29 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  32.81 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  40.32 
 
 		 574 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3079  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03364  hypothetical protein  40.38 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  46 
 
 		 917 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0606  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 506 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.62 
 
 		 862 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  34.48 
 
 		 202 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 215 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  27.23 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  30.15 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 471 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10861  nitrate/nitrite response transcriptional regulatory protein narL  43.75 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000061441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.35 
 
 		 215 aa  43.9  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2563  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  38.89 
 
 		 1003 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0293  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 222 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 454 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 222 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2335  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.938318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 501 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.88 
 
 		 229 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2289  regulatory protein LuxR  35.48 
 
 		 151 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 214 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>