42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2833 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 222 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  86.49 
 
 		 226 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  38.85 
 
 		 284 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 296 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 264 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 284 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  41.27 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  27.52 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  27.89 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  46.39 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  28.32 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 269 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  33.6 
 
 		 268 aa  52  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 277 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3764  response regulator receiver  39.39 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321181  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 303 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 259 aa  45.1  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 280 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  27.87 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 272 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  44.44 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  46.3 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>