More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7524 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 277 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 270 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 301 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 271 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 259 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  33.61 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  30 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  27.5 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  28.08 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  50.98 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  26.14 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  27.16 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6272  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 394 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  33.82 
 
 		 214 aa  52.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  29.1 
 
 		 284 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 216 aa  52.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  33.85 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2775  transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 481 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.257993  normal  0.934511 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5553  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  32.35 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  31.01 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 339 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  32.86 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1834  two component LuxR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.567429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  29.55 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  47.27 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  33.33 
 
 		 226 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 378 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  32.93 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.59 
 
 		 469 aa  49.7  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0175254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  37.5 
 
 		 955 aa  49.3  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.89 
 
 		 215 aa  49.3  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1731  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 361 aa  49.3  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13460  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.29 
 
 		 472 aa  49.3  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1761  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  31.51 
 
 		 214 aa  48.9  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  25.16 
 
 		 247 aa  48.9  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003098  BarA-associated response regulator UvrY  30.88 
 
 		 188 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000268807  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  30.88 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5287  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 206 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  30.99 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  31.63 
 
 		 1005 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  30.14 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2723  transcriptional regulator, LuxR family  25.79 
 
 		 509 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  25.2 
 
 		 226 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3242  two component LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000371761  hitchhiker  0.000468813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0164  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0153554  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0506  transcriptional regulator, LuxR family  34.04 
 
 		 519 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  30.68 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0774  regulatory protein, LuxR  37.88 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  27.94 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  27.94 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  27.94 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  27.94 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  27.94 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>