51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4773 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  99.63 
 
 		 294 aa  550  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  99.63 
 
 		 294 aa  550  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  93.33 
 
 		 301 aa  521  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  93.7 
 
 		 294 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  89.71 
 
 		 278 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  90.07 
 
 		 277 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 276 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  29.12 
 
 		 268 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  29.73 
 
 		 257 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 284 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  28.98 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  26.91 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  29.41 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  36.11 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  23.9 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  30.84 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 269 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 215 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  23.28 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  22.31 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  26.48 
 
 		 881 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 856 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2335  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 209 aa  42.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.938318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 263 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>